11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析

发布时间：2017-10-12 18:01

  本文关键词：11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析

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【摘要】：[目的]研究白桦中SPL转录因子的基因序列特征及其在不同时期不同组织中的表达规律。[方法]依据白桦45个转录组测序结果,共获得12条全长SPL基因,依次命名为白桦BpSPL1-BpSPL12,对其中11条BpSPL进行了生物信息学及基因表达特征分析。[结果]生物信息学分析发现,11条BpSPL均含有1个高度保守的SBP结构域,且基因长度差异较大,含有2 10个不等数目的外显子,系统进化分析发现11条白桦SPL分属于六大类SPL蛋白;qRT-PCR分析结果显示,白桦BpSPL基因在不同时期的叶、顶芽、茎、雄花序中表达变化显著,多数SPL基因在顶芽中7月5日和8月20日至9月20日时期表达较高,除BpSPL1基因外在雄花序从6月份到9月份的生长阶段中,SPL的表达水平呈现逐渐升高的总体趋势。[结论]BpSPL基因可能参与到了白桦顶芽和雄花序的生长发育过程。
【作者单位】： 林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学;
【关键词】： 白桦 BpSPL基因家族 生物信息学 基因表达
【基金】：“十二五”农村领域国家科技计划课题—“水曲柳和白桦珍贵用材林定向培育技术研究与示范”(2012BAD21B02)
【分类号】：S792.153
【正文快照】： SPL(SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE)基因编码高等植物所特有的转录因子,其典型特征是含有一个高度保守的SBP(Squamosa promoterBinding Protein)结构域。在拟南芥(Arabidopsis thalianaL.Heynh)中研究发现,SPL基因是花时调控的关键基因。At SPL3编码的蛋白能够识别，

本文编号：1020120