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TMV和PVX胁迫下云烟和番茄实时荧光定量内参基因筛选

发布时间:2017-10-13 08:17

  本文关键词:TMV和PVX胁迫下云烟和番茄实时荧光定量内参基因筛选


  更多相关文章: 烟草花叶病毒 马铃薯X病毒 寄主 实时荧光定量PCR 内参基因


【摘要】:合适的内参基因是采用实时荧光定量PCR研究基因表达获得可信数据的基础.为了获得合适的内参基因,更好地研究烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)和马铃薯X病毒(Potato virus X,PVX)与烟草和番茄2种寄主的互作,本项研究根据已报道的云烟和番茄看家基因设计引物,使用geNormPlus软件分别对其在TMV和PVX侵染下的云烟97和番茄中表达量的稳定性进行了评估.结果表明:2种寄主植物中供试看家基因中各有4对引物满足qPCR的要求,分别是云烟tub,CYP,GAPDH,β-tub,番茄18S,UK,ACT,EFl-α.在2种病毒侵染后的云烟内参基因中表达最稳定的为CYP,番茄中内参基因为ACT.最终确定这2个看家基因分别作为实时荧光定量PCR研究烟草和番茄在TMV和PVX胁迫下寄主体内基因表达变化的内参基因.该结果为进一步探讨2种病毒共同侵染时,它们与烟草和番茄2种寄主互作生物学效应研究奠定了基础.
【作者单位】: 西南大学植物保护学院/植物病害生物学重庆市高校级重点实验室;
【关键词】烟草花叶病毒 马铃薯X病毒 寄主 实时荧光定量PCR 内参基因
【基金】:国家自然科学基金(30900937) 重庆市自然科学基金(CSTC2010BB1122) 中央高校基本科研业务费(XNJI2009B023;2362014xk08)
【分类号】:Q943.2;S432.41
【正文快照】: 近年来,实时荧光定量PCR技术(Quantitative real time PCR,RT-qPCR)是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术,具有快速、高灵敏度等优点,能够准确分析在不同时期及经过不同处理的基因表达差异[1-3].在基因定量表达研究中,被用作内参基因的看家基因(Housekeeping gene)的

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本文编号:1023769

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