香蕉β-淀粉酶基因家族的系统进化分析

发布时间：2017-10-13 14:03

  本文关键词：香蕉β-淀粉酶基因家族的系统进化分析

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【摘要】：β-淀粉酶(beta-amylase,Bmy)是一类关键的淀粉水解酶,在香蕉果实成熟淀粉降解转化为可溶性糖的过程中发挥着重要的作用。为了全面了解Bmy基因在香蕉基因组中的特征,研究基于香蕉基因组数据,通过生物信息学的方法对香蕉Bmy基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、内含子和外显子结构和保守结构域进行初步的预测与分析,并构建系统发育树。结果表明:编码香蕉β-淀粉酶的基因有15个,根据在染色体的位置命名为Ma Bmy1~15,Ma Bmy基因家族编码的氨基酸范围在68~1 453 aa,编码的蛋白相对分子量介于7.8~162.6 ku之间,15个Ma Bmy蛋白中有10个偏酸性,5个偏碱性。不稳定指数分析发现6个Ma Bmy蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的Ma Bmy蛋白为亲水性蛋白;香蕉Ma Bmy家族内含子最少含有2个,最多的含有10个;进化分析表明,Ma Bmy家族分4个亚家族,且与水稻的亲缘关系较近。研究结果为深入探讨Ma Bmy基因的功能及调控香蕉果实成熟的应用奠定基础。
【作者单位】： 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所农业部热带果树生物学重点实验室;
【关键词】： 香蕉 β-淀粉酶 基因家族 系统进化分析
【基金】：国家香蕉产业技术体系湛江试验站项目(No.CARS-32-12) 海南省自然科学基金(No.20153134)
【分类号】：S668.1
【正文快照】： Bmy(EC3.2.1.2)是一种外切酶,作用于α-1,4-线性糖苷链的非还原末端,逐次以麦芽糖为单位切断α-1,4-葡聚糖链,从而产生麦芽糖和有限糊精[1]。Bmy属于糖苷水解酶家族14,含有一个保守结构域Glyco_hydro_14结构域(PF01373)。这个保守结构域含有2个高度保守的区域,分别位于N端以及

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本文编号：1025243