miR-199a-3p靶基因预测及生物信息学分析

发布时间：2017-10-13 18:19

  本文关键词：miR-199a-3p靶基因预测及生物信息学分析

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【摘要】：目的为深入研究miR-199a-3p在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析miR-199a-3p序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析;构建TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果 miR-199a-3p序列在多物种间具有高度保守性;GO分析发现miR-199a-3p的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P0.01);KEGG Pathway分析发现miR-199a-3p的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM受体的相互作用通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等;根据构建的TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受miR-199a-3p调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论 miR-199a-3p可能通过直接靶向作用mTOR,调节PI3K-Akt-mTOR信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。
【作者单位】： 陕西省临床检验中心;西安交通大学第一附属医院检验科;
【关键词】： miR-a-p 生物信息学 mTOR GO富集分析 KEGG Pathway分析 膀胱癌 PIK-Akt MAPK 蛋白聚糖
【分类号】：R737.14
【正文快照】： miRNA是高度保守的非蛋白编码的小RNA,长度约22nt。成熟的miRNA通过介导目的基因沉默,使靶miRNA降解,从而调控转录后基因表达水平[1]。miRNA几乎参与了所有生命活动过程的调节,并且在肿瘤的发生、发展中起重要作用。多项研究表明许多miRNA参与膀胱癌的进展,文献报道miR-199a-3

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