大豆MPBQ-MT基因的克隆与生物信息学分析

发布时间：2017-10-17 03:27

  本文关键词：大豆MPBQ-MT基因的克隆与生物信息学分析

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【摘要】：以大豆品种合丰25和Bayfield为材料,克隆大豆2-甲基-6-植基-1,4-苯醌甲基转移酶(MPBQMTase)基因,获得1 029 bp的MPBQ-MT基因c DNA序列。通过序列比对发现10个大豆MPBQ-MT基因c DNA区内的潜在SNP位点。采用生物信息学方法分析MPBQ-MT基因编码的氨基酸序列和蛋白质结构。结果表明:MPBQ-MT基因CDS区共编码342个氨基酸,其中缬氨酸(Val)含量最多,占该基因编码氨基酸总数的8.8%;半胱氨酸(Cys)含量最少,占该基因编码氨基酸总数的1.2%;MPBQ-MT蛋白N端包含由58个氨基酸组成的叶绿体转运肽,为亲水性蛋白质。合丰25与Bayfield的MPBQ-MT蛋白质二级结构有所不同,2个品种的MPBQ-MT蛋白质中α-螺旋分别约占25.44%和27.49%,β-转角分别约占9.36%和9.06%,无规则卷曲分别约占40.35%和38.60%。2个品种的MPBQMT蛋白质中片层结构均约占24.85%。两个品种的MPBQ-MT蛋白质均有1个S-腺苷基甲硫氨酸结合位点。对MPBQ-MT蛋白三级结构进行预测,发现去掉转运肽后,MPBQ-MT蛋白质三级结构主要由11个连续的α-螺旋区域和8个连续的片层结构区域组成。结合MPBQ-MT蛋白三级结构对MPBQ-MT基因的生物学功能进一步分析,提出了较为合理的MPBQ-MT作用模型。由系统发生树可知MPBQ-MT蛋白在大豆与菜豆中的亲缘关系较近。
【作者单位】： 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室;
【关键词】： 大豆 维生素E MPBQ-MT基因 生物信息学分析
【基金】：中国博士后项目(20110491025) 东北农业大学博士启动基金(2012RCB32)
【分类号】：S565.1
【正文快照】： 维生素E是一种脂溶性的维生素,又称生育酚、生殖维生素等,是一类广泛存在于高等动植物体内的天然强抗氧化剂。维生素E是一类同系物的总称,自然界中有8种类型,分别为α、β、γ和δ-生育酚(toeopherol)及α、β、γ和δ-生育三烯酚(to-cotrienol)[1],它们的区别在于苯环上甲基

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本文编号：1046556