侵染新疆甜瓜的ZYMV衣壳蛋白基因克隆及其序列分析

发布时间：2017-10-17 12:36

  本文关键词：侵染新疆甜瓜的ZYMV衣壳蛋白基因克隆及其序列分析

  更多相关文章： 新疆 小西葫芦黄瓜花叶病毒(ZYMV) 克隆 序列分析 蛋白稳定性 环境影响

【摘要】：新疆作为中国有名的瓜果之乡,其瓜类不仅成为其中最具代表性的品牌也日益成为农民增收致富的经济支柱产业。然而近年来由于新疆瓜果日益受到病毒病威胁,严重时造成大面积减产甚至绝收,大幅度制约了农民生产积极性和生活水平的提高。小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是其中比较具有代表性的病毒,为了对新疆不同主栽地区甜瓜(Cucumis melo)ZYMV进行生物防治和抗病毒甜瓜的研究。本研究利用同源克隆的方法,扩增获得了新疆19个样点ZYMV分离物衣壳蛋白(coat protein,CP)基因全长序列,ZYMV分离物CP基因全长介于1 080~1 180 bp,编码253~301个氨基酸,蛋白质大小约33 k D。序列比对发现,ZYMV核酸序列的3'和5'非编码区末端保守性较低,编码区及其周围序列保守性较高,氨基酸序列的N端保守性高于C端。ZYMV同源性比对结果发现,病毒属于同一ZYMV基因型。通过核酸序列构建的分子进化树可以将ZYMV分为4个亚组,亚组分离依据符合地区分布特性。根据对蛋白质理化性质,包括蛋白质的动力学、化学和热力学稳定性分析得出,ZYMV均属于稳定性蛋白。结合新疆夏季平均降水量和平均气温变化趋势发现,其与对应地区ZYMV CP的疏水性指数和脂溶性指数的变化趋势存在一定相关性。分析认为,不同地区ZYMV CP的稳定性存在一定的差异,这可能与新疆特殊的气候条件与分离物所处地理环境有关。本研究通过序列分析获得19个样点ZYMV CP核酸序列以及CP特征,为今后以RNA干扰技术或基因组编辑技术培育抗病毒甜瓜,进行生物农药研发等提供了基础的数据支持,同时为开展对植物病毒的致病机理以及探究环境与病毒传播机制的研究提供初期的研究方向。
【作者单位】： 新疆农业大学农学院;新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室;
【关键词】： 新疆 小西葫芦黄瓜花叶病毒(ZYMV) 克隆 序列分析 蛋白稳定性 环境影响
【基金】：中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(No.YB201307)
【分类号】：S436.5
【正文快照】： 乌鲁木齐830091小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaicvirus,ZYMV)为马铃薯Y病毒属(Potyvirus)重要成员,是一种广泛分布于葫芦科作物,具有世界性危害的主要病毒(古勤生等,2003)。20世纪70年代初在欧洲首次被发现,其后在中东、美国、法国和台湾等地区开始大规模流行与蔓延

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 秘晶玮,王君伟,许丽娜,李洪涛;鹅α和γ干扰素基因的克隆及序列分析[J];中国预防兽医学报;2005年05期

2 窦永喜,才学鹏,景志忠;猪粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子基因的克隆、序列分析及蛋白结构预测[J];中国预防兽医学报;2005年06期

3 吴阳;李晨阳;李玲玲;焦道忠;李春利;张宁宁;王岁楼;;猪血清白蛋白基因的克隆与序列分析[J];动物医学进展;2007年03期

4 乔军;夏咸柱;杨松涛;鞠会艳;黄耕;;猫白介素-18基因的克隆、序列分析及其表达[J];农业生物技术学报;2007年02期

5 王伟杰;郭豫杰;王月影;乔新安;杨森;王艳玲;杨国宇;;鸡Muslin cDNA克隆与序列分析[J];华北农学报;2007年04期

6 史斌;龙塔;赵战勤;薛云;;16S rRNA序列分析在猪肠道细菌鉴定中的应用[J];河南农业科学;2013年06期

7 王芳,何孔旺;猪传染性胸膜肺炎放线杆菌转铁结合蛋白2基因克隆、序列分析及表达[J];农业生物技术学报;2005年02期

8 谭世君;汤明;聂奎;王楷[，

本文编号：1048913