ROS1融合基因检测方法的建立
发布时间:2017-10-18 21:00
本文关键词:ROS1融合基因检测方法的建立
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【摘要】:目的:建立检测ROS1融合基因的荧光PCR法,为肺癌病人的个体化药物治疗提供新的检测试剂盒。方法:根据人类ROS1基因的外显子和融合伙伴基因的外显子序列设计引物和探针,建立ROS1融合基因的荧光PCR法。然后采用不同ROS1基因融合的假病毒质粒作为质控品,评价方法的准确性、检测限和特异性。检测350例临床样本,并与直接测序结果进行比较,评价方法的临床适用性。结果:建立的ROS1融合基因PCR-荧光探针法,能准确检测出14种不同的ROS1融合基因;检测限是不高于总量0.01μg的RNA模板;正常人RNA的结果显示为融合突变阴性。临床样本的结果与测序结果的一致性好,Kappa值为1.00。结论:建立的ROS1融合基因检测方法具有很好的准确性、检测限和特异性,并且具有很好的临床适用性。
【作者单位】: 中国食品药品检定研究院;湖北省肿瘤医院检验科;武汉友芝友医疗科技有限公司;
【关键词】: 肺癌驱动基因 ROS原癌基因 融合基因 荧光聚合酶链式反应 个体化靶向治疗
【分类号】:R734.2
【正文快照】: 2方法2.1方法的建立应用Primer Premier 5.0及Primer Express 3.0软件,根据ROS1基因的外显子(32、34、35、36)序列和融合伙伴基因(SLC34A2、CD74、SDC4、EZR、LRIG3、TPM3和GOPC)断裂外显子序列,设计特异性引物和探针,同时选择β2微球蛋白(B2M)基因作为质控基因。通过4个不同
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本文编号:1057105
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