裸子植物psbA基因分子进化式样的研究

发布时间：2017-10-22 08:11

本文关键词：裸子植物psbA基因分子进化式样的研究

【摘要】：为阐明裸子植物对陆生生境生态响应的分子机制,以新近的裸子植物分类系统为指导,基于psb A基因编码全序列对4亚纲53种代表植物进行分子进化分析。首先,依据"放松分子钟"模型重建裸子植物在时间尺度下系统发育关系;其次,采用6个模型(MEC/JTT、MEC/cp REV、M5、M7、M8、M8a)估测氨基酸位点ω值,并对各模型结果进行统计检测;随后,利用Bootstrap方法检PSBA蛋白内部氨基酸位点的共进化动态。结果表明,系统树提示的物种分化历程支持前期分类结果;光合系统反应中心核心PSBA蛋白有3个氨基酸位点(13、19和243)曾经受正选择压力;PSBA蛋白内部有多对氨基酸位点间构成了共进化网络。因此,psb A基因编码序列具有作为描绘裸子植物系统发育关系标记的潜力,PSBA蛋白部分位点经历了适应性进化,通过位点间共进化网络协同作用方式辅助裸子植物响应陆生生境。
【作者单位】：湖北中医药大学中药资源与中药复方教育部重点实验室;湖北中医药大学药学院;
【关键词】： 裸子植物 响应机制 放松分子钟模型 适应性进化 共进化
【基金】：国家自然科学基金青年项目(31500260) 湖北中医药大学教育部重点实验室科研启动经费(5114000914)资助~~
【分类号】：Q943
【正文快照】： 近年来,植物系统分类状况出现了较大转变[1],木贼纲(Equisetopsida)被用来总括全部陆生植物,约1026种裸子植物(Gymnosperms)被列入4亚纲(subclass)[2]:即苏铁亚纲(Cycadidae)、银杏亚纲(Ginkgoidae)、买麻藤亚纲(Gnetidae)和松柏亚纲(Pinidae)。苏铁亚纲含1目2科,即苏铁目(Cyc

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