云南蔗区甘蔗线条花叶病毒分离物NIa基因形成新簇

发布时间：2017-10-23 04:14

  本文关键词：云南蔗区甘蔗线条花叶病毒分离物NIa基因形成新簇

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【摘要】：【目的】利用NIa基因,阐明甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的种系发生关系,为预测SCSMV流行变异趋势及科学防控提供理论依据。【方法】从云南蔗区和国家甘蔗种质资源圃采集感病样品,RT-PCR扩增获得SCSMV NIa基因序列后,使用Splits Tree、RDP、Phy ML、Dna SP等软件分析SCSMV中国分离物的系统发生、选择压力及基因流动等特征。【结果】共获得23条SCSMV NIa基因序列。这些序列间未发生重组,云南蔗区的部分序列形成1个新簇,且云南蔗区与国家甘蔗种质资源圃之间的基因交流不显著。此外,选择压力分析表明,NIa基因受很强的负选择压力作用。【结论】与P1、HC-Pro和CP等基因类似,SCSMV在NIa基因上也包含5个簇;SCSMV云南分离物具有较高的遗传多样性和清晰的地理相关性。
【作者单位】： 扬州大学园艺与植物保护学院;中国农业科学院植物保护研究所 植物病虫害生物学国家重点实验室;云南省农业科学院甘蔗研究所 云南省甘蔗遗传改良重点实验室;
【关键词】： 甘蔗线条花叶病毒 NIa基因 系统发生
【基金】：国家自然科学基金(31601604) 植物病虫害生物学国家重点实验室开放课题(SKLOF201518) 扬州大学科技创新培育基金(2015CXJ043)~~
【分类号】：S435.661
【正文快照】： 甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)属于马铃薯Y病毒科(Potyviridae)禾本科病毒属(Poacevirus)。该病毒首先在甘蔗花叶病株上发现,自然条件下能够侵染甘蔗、高粱和一些禾本科杂草[1 4]。SCSMV侵染甘蔗引起长短不一的线条形花叶症状,发生普遍时能够引起甘

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1 杨兰英，项瑜，魏宁生，，彭学贤;马铃薯Y病毒6kD和NIa基因转化的烟草介导抗病性[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);1996年02期

本文编号：1081543