基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因

发布时间：2017-10-25 20:15

  本文关键词：基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因

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【摘要】：[目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。
【作者单位】： 山西农业大学农学院;特色杂粮种质资源发掘与育种改良山西省重点实验室;山西农业大学农业生物工程研究所;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;
【关键词】： 谷子 泛素连接酶E 干旱胁迫 表达谱
【基金】：国家自然科学基金(31371693,31471556,31401396)
【分类号】：S515
【正文快照】： 谷子(Setaria italica),禾本科,狗尾草属,在我国已有7 000多年的栽培史[1],广泛分布于我国北方干旱与半干旱地区,具有抗旱耐贫瘠特性,是一种适应性较广的小杂粮。干旱是影响作物生长发育的关键因素之一,因此发掘谷子抗旱相关基因对产量提高尤为重要。泛素蛋白酶体系统(ubiquit

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本文编号：1095320