β-catenin调控小鼠肾脏发育的基因表达谱富集分析

发布时间：2017-10-30 19:27

  本文关键词：β-catenin调控小鼠肾脏发育的基因表达谱富集分析

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【摘要】：敲除β-catenin基因的第3号外显子可使其过表达。以往很多研究主要通过基因表达谱分析β-catenin过表达对肾脏发育产生的影响,并鉴定了多个关键基因。但相关通路及相关通路间的共表达模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究选取公共数据库GEO(gene expression omnibus)中和小鼠β-catenin过表达肾脏转录组密切相关微阵列(microarray)数据集作为研究对象,并进行GSEA(gene set enrichment analysis)分析,筛选相关转录因子。我们鉴定出了63条被β-catenin上调的通路如Notch信号通路(Notch signaling pathway),以及43条被下调的通路如ABC转运体(ABC transporters)等通路。最终,我们构建了包含有核心基因和转录因子如STATs的相关通路共表达网络,我们的研究结果将帮助我们更好地在全基因组层面上了解β-catenin对于小鼠肾脏发育的调控作用。
【作者单位】： 安徽大学生命科学学院干细胞及转化医学研究中心;
【关键词】： β-catenin 肾脏 发育不全 基因表达谱 调控机制
【基金】：安徽省自然科学基金面上项目(1508085MH189) 国家自然科学基金面上项目(Y06050525)共同资助
【分类号】：Q344
【正文快照】： 哺乳动物肾脏起源于中胚层外段的细胞团,肾脏发育主要经历3个阶段,即原肾、中肾和后肾。小鼠的临时性肾脏结构原肾和中肾形成于胚胎发育的第8~10天(即E8~E10时期),E10.5天后将发育出成熟的肾脏结构后肾(Lechner and Dressler,1997)。肾脏最终结构的形成依赖于输尿管芽与后肾间

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本文编号：1118989