芥菜型油菜多室基因Bjln2定位的研究
本文关键词:芥菜型油菜多室基因Bjln2定位的研究
【摘要】:油菜是我国最重要的油料作物,油菜产量的提高对于保障我国食用油供给安全具有重要意义,而优异种质资源的开发和利用,是培育高产品种、提高产量的一条重要途径。研究表明,油菜角果的心室数目与产量有关,在相同的遗传背景下,多室油菜的产量显著高于二室油菜的产量。青海芥菜型多室油菜是源于青藏高原的地方品种,产生的角果通常具有3-4排种子,具有多室的性状。前人研究结果表明,青海芥菜型油菜的多室性状受2对隐性基因(Bjln1和Bjln2)控制,其中的一对基因Bjln1已定位于白菜A7染色体上一段208 kb的同源区间内。在此基础上,本研究利用青海芥菜型多室油菜与塔油2号杂交,再与多室油菜回交构建的BC1分离群体中的二室单株,与多室油菜连续回交构建了Bjln2位点分离的BC4群体(NIL2)。利用AFLP与BSA相结合的方法对多室基因Bjln2进行初步定位。同时探索了芥菜型油菜多室基因Bjln1和Bjln2之间的关系。获得的主要研究结果如下:1.等位性分析:对NIL1(用于Bjln1基因定位的BC4分离群体)和NIL2中的杂合位点进行等位性分析,为多室基因Bjln2定位群体的确定打下了基础。利用NIL1和NIL2群体中的二室单株进行杂交,获得的F1与多室油菜回交获得BC1,同时F1自交获得F2分离群体。通过对F2和BC1群体各株系内二室与多室单株分离比调查后发现,F2群体内既有3:1分离比的株系,又有15:1分离比的株系;同时,BC1群体内也同时存在1:1分离比和3:1分离比的株系。这些结果表明Bjln1基因与Bjln2基因是不等位的,NIL2群体中的二室株和多室株的基因型分别为Bjln1Bjln1Bj Ln2Bjln2,Bjln1Bjln1Bjln2Bjln2。2.标记筛选:利用NIL2群体作为多室基因Bjln2的定位群体。通过AFLP与BSA法,同时结合比较基因组学的研究,共筛选到与多室基因Bjln2紧密连锁的分子标记20个,其中包括17个AFLP分子标记,1个SSR标记1个IP标记和1个SCAR标记。3.图谱构建:利用筛选得到的20个分子标记构建多室基因Bjln2所在区域的遗传连锁图谱。两侧最近标记分别为AF13、N1和AF15、AF16、At90,它们与目标基因之间的遗传距离分别为3.1 c M(AF13、N1)和0.7 c M(AF15、AF16、At90);获得一个共分离标记A1。4.基因定位:利用17个AFLP标记特异片段克隆测序后同源比对的结果结合筛选到的其余3个标记信息,我们推测多室基因Bjln2可能位于芥菜型油菜的B7染色体上。
【关键词】:芥菜型油菜 多室 基因定位
【学位授予单位】:青海大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S565.4
【目录】:
- 摘要4-6
- Abstract6-10
- 第1章 文献综述10-19
- 1.1 多室油菜的研究进展10-14
- 1.1.1 多室油菜种类及表型10-11
- 1.1.2 多室油菜角果的解剖学研究11
- 1.1.3 油菜多室性状遗传规律的研究11-12
- 1.1.4 油菜多室基因定位的研究12
- 1.1.5 油菜多室基因克隆的研究12-13
- 1.1.6 油菜多室基因遗传机理的研究13-14
- 1.1.7 其他植物多室性状的研究14
- 1.2 分子标记的研究与利用14-16
- 1.2.1 常见的几种分子标记及其应用14-16
- 1.2.2 分子标记辅助选择16
- 1.3 比较基因组学在芸薹属的研究与利用16-18
- 1.3.1 芸薹属比较基因组研究进展16-17
- 1.3.2 芸薹属与拟南芥比较基因组研究进展17-18
- 1.4 本研究的目的和意义18-19
- 第2章 材料与方法19-29
- 2.1 试验材料19-20
- 2.2 试验方法20-29
- 2.2.1 群体构建与等位性分析20-23
- 2.2.1.1 群体构建20-22
- 2.2.1.2 性状调查和统计22-23
- 2.2.2 芥菜型油菜多室基因Bjln2的定位23-29
- 2.2.2.1 DNA提取及性状调查23
- 2.2.2.2 AFLP与BSA分析23-27
- 2.2.2.3 AFLP特异片段的回收、连接、克隆和测序27-28
- 2.2.2.4 SSR和IP等标记的筛选、测序28
- 2.2.2.5 与拟南芥、白菜型油菜基因组序列共线性分析28
- 2.2.2.6 遗传连锁图谱的构建28-29
- 第3章 结果与分析29-37
- 3.1 回交群体的等位性分析29-30
- 3.2 多室基因Bjln2的初步定位30-36
- 3.2.1 BC4分离群体果室性状表现30-31
- 3.2.2 标记筛选结果31-33
- 3.2.3 构建与Bjln2基因连锁遗传图谱33-35
- 3.2.4 Bjln2基因的初步定位35-36
- 3.3 小结36-37
- 第4章 讨论37-39
- 4.1 芥菜型油菜多室基因等位性分析37
- 4.2 芥菜型油菜多室基因Bjln2的定位37-39
- 参考文献39-46
- 致谢46-47
- 附录47-49
- 作者简介49
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,本文编号:1135624
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