2014—2015年我国华东部分地区猪流行性腹泻病毒的检测及S基因的序列分析

发布时间：2017-11-04 14:41

  本文关键词：2014—2015年我国华东部分地区猪流行性腹泻病毒的检测及S基因的序列分析

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【摘要】：采用RT-PCR方法对2014年至2015年送至实验室的104份腹泻仔猪小肠组织病料进行检测,结果显示42份为猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性,选择不同地区的7份阳性病料进行S基因克隆和测序,并与Gen Bank中已发布的PEDV S基因比对分析。核苷酸和氨基酸比对结果显示,7株流行毒株S基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别是98.1%~99.2%和97.6%~99.1%。该7株流行毒株与经典毒株CV777和DR13核苷酸序列的同源性分别为94.0%~94.2%和93.9%~94.1%,氨基酸序列的同源性分别为93.1%~93.6%和92.5%~93.1%。S基因进化树分析结果表明,根据S基因的变异情况PEDV可以分为3个型,本试验分析的7株PEDV流行毒株均属于Ⅲ型,与2012年以来中国流行毒株的亲缘关系较近,与国外传统毒株和中国较早分离到的毒株的亲缘关系较远。
【作者单位】： 南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室;
【基金】：南京农业大学校内项目(KJQN201619)
【分类号】：S852.651
【正文快照】： 猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrheavirus,PEDV)是引起猪流行性腹泻(porcine epidemicdiarrhea,PED)的主要病原,PED临床上以腹泻、呕吐、脱水以及哺乳仔猪的高死亡率为特征[1-2]。由于其传染性强和较短的病程,尤其是对7日龄内的仔猪,其病死率接近100%,给养猪业带来巨

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