中东呼吸综合征冠状病毒结构蛋白与附属蛋白编码基因密码子偏爱性分析

发布时间：2017-11-06 20:29

  本文关键词：中东呼吸综合征冠状病毒结构蛋白与附属蛋白编码基因密码子偏爱性分析

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【摘要】：中东呼吸综合征冠状病毒是一类对人类危害极重的RNA病毒,为了解其密码子使用特点和主要影响因素,该文采用CHIPS、CUSP、CodonW和SPSS软件对MERS-CoV 9条基因序列进行了偏爱性分析和多元统计分析,获得了每个基因密码子3个位置的GC含量和ENC值以及所有基因序列的RSCU值,并与大肠杆菌、酵母、人的密码子使用频率进行了对比分析。结果显示GC3明显低于GC2、GC1且小于50%,ENC值为50.59,表明该病毒密码子偏爱性偏低且偏爱以A、T碱基结尾的密码子。中性绘图和ENC绘图分析表明密码子的偏爱性主要受到选择作用的影响。通过和其它三种生物密码子使用频率进行比较,发现其与酵母密码子使用频率相差最小。在此基础上确定了MERS-CoV的19个最优密码子。研究结果对MERS-CoV寻找最佳宿主进行体外表达,从而研发基因工程疫苗及治疗性抗体具有一定的意义。
【作者单位】： 四川农业大学生命科学学院;
【基金】：2013年四川省教育厅青年基金项目 2015年四川农业大学生命科学学院学科建设项目 四川农业大学双支计划
【分类号】：R373
【正文快照】： 生物体遗传信息传递遵循“中心法则”,贮存在DNA上的遗传信息通过mRNA传递到蛋白质上,mRNA通过三联体密码子与氨基酸联系在一起,编码同一氨基酸的不同密码子称为该氨基酸的同义密码子。研究表明,生物体内同义密码子的使用并不是随机的,而是不同物种或同一物种的不同基因在编码

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本文编号：1149286