刚地弓形虫ROP16基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-11-07 07:19

  本文关键词：刚地弓形虫ROP16基因的克隆及生物信息学分析

  更多相关文章： 刚地弓形虫 ROP 真核表达 生物信息学分析

【摘要】：目的构建刚地弓形虫棒状体蛋白16(TgROP16)真核重组表达载体,对TgROP16基因编码蛋白进行生物信息学分析。方法提取刚地弓形虫总RNA,根据TgROP16基因的开放阅读框架设计引物,采用逆转录PCR(RTPCR)扩增ROP16基因,经EcoR I、Not I酶切后连接入真核表达载体pVAX1中,连接产物转化大肠埃希菌(E.coli)XL1-Blue。提取阳性菌落质粒,进行PCR、双酶切鉴定及基因测序,对所获序列进行生物信息学分析。结果 TgROP基因RT-PCR扩增产物与预期一致,大小约为2 100bp。重组质粒经PCR及双酶切鉴定构建正确。测序显示获得的TgROP16基因片段为2 124bp,与GenBank已收录的弓形虫ROP16基因序列(登录号为GQ249093.1)比对,一致性为99.8%。预测其编码蛋白TgROP16为非跨膜分泌蛋白,含707个氨基酸,分子式为C3343H5339N967O1024S2,分子质量单位为76.1352ku,理论等电点为9.18;在TgROP16蛋白的二级结构中α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占比35.79%、14.29%、7.07%和42.86%;含多个可形成卷曲螺旋构象的区域与可成为磷酸化位点的氨基酸残基,存在信号肽序列,含39个B细胞抗原表位、24个CTL细胞抗原表位及33个Th细胞抗原表位。结论成功构建了pVAX1-ROP16真核表达重组质粒,生物信息学分析表明其编码蛋白TgROP16具有良好的抗原性及免疫原性,有望作为弓形虫疫苗候选分子。
【作者单位】： 河北北方学院病原生物学与免疫学研究所;
【基金】：河北北方学院校级重大课题(No.ZD201312)
【分类号】：R382.5
【正文快照】： ***动物中的大多数种属,有超过30种鸟类和300种哺乳动物被感染,以人类的感染多见[1]。孕妇早期感染怀刚地弓形虫孕可导致流产或死胎,存活胎儿也可出现脉络膜视网膜炎、脑积水、头小畸形、颅内钙化等异常。T细胞缺陷如器官移植受者、AIDS患者、恶性血液病患者、免疫治疗法接受

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 谭从娥;王米渠;冯文哲;徐全壹;;生物信息学分析寒证海量数据的探索[J];中华中医药学刊;2008年12期

2 程勇前;成军;刘妍;王琳;徐东平;钟彦伟;曲建慧;赵平;;钙离子调节亲环素配体及其不同剪接体的克隆及生物信息学分析[J];医学研究生学报;2008年05期

3 杨向东,王仁,刘俊文,唐蔚青,李红霞,王抒;一个新的人突触相关蛋白基因的生物信息学分析[J];中国动脉硬化杂志;2004年01期

4 张艳宇,马平,陆一鸣,吕丽萍,姜升阳,周锡鹏,孙树汉,许金波;尖吻蝮蛇类凝血酶基因的克隆及生物信息学分析[J];中国实验血液学杂志;2005年04期

5 张孝勇;崔光彬;杜滂;马克军;王亚蓉;韩苇;颜真;张英起;魏经国;;兔大电导钙敏感性钾离子通道β亚基的克隆及生物信息学分析[J];第四军医大学学报;2007年09期

6 蔡群芳;邬强;闫玉兰;吕刚;;欧猥迭宫绦虫谷胱甘肽转移酶1基因序列与功能的生物信息学分析[J];海南医学院学报;2013年05期

7 魏锁成;巩转娣;韦敏;;雄兔垂体GnRHR的序列测定与生物信息学分析[J];中国实验动物学报;2011年01期

8 尹积荣;杨凯;白玉兴;王邦康;;牙齿发育相关基因Osr2的生物信息学分析[J];现代生物医学进展;2011年14期

9 周金华;朱涛;李红雨;徐钢;王世宣;周剑锋;卢运萍;马丁;;基于WEB页面的生物信息学分析平台的构建及其应用[J];中国现代医学杂志;2006年17期

10 佘高明;聂Pr;张同园;李聪;刘炜;阮绪芝;;新基因FAM92A1的生物信息学分析及功能预测[J];郧阳医学院学报;2008年04期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 焦斐;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;丁学智;褚敏;吴晓云;刘建;;牛FAS基因的生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年

2 唐爱发;余振东;桂耀庭;郭新;李贤新;周锦堂;朱辉;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表达及其生物信息学分析[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年

3 刘惠君;谭宇蓉;刘持;向阳;屈飞;秦晓群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息学分析及功能研究[A];湖南省生理科学会2008年度学术年会论文摘要汇编[C];2008年

4 黄浩;陆启轩;陈临溪;杨莉;毛小环;李兰芳;秦旭平;曹建刚;;APJ受体的生物信息学分析[A];全国第十二届生化与分子药理学学术会议论文集[C];2011年

5 陈大清;吴功庆;李亚男;;淹水胁迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息学分析[A];2005'海峡两岸植物生理与分子生物学教学研讨会论文集[C];2005年

6 田琪琳;施定基;贾晓会;王晓燕;黄希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息学分析[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年

7 陈玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭锡熔;;miR-146b靶基因预测和生物信息学分析[A];2012年江浙沪儿科学术年会暨浙江省医学会儿科学分会学术年会、儿内科疾病诊治新进展国家级学习班论文汇编[C];2012年

8 苑赞;赵锦;刘孟军;;枣花粉过敏原Zizj1基因的克隆与生物信息学分析[A];第八届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2013年

9 王玲;高莲;李健;赖松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息学分析[A];第五届中国畜牧科技论坛论文集[C];2011年

10 李婷;张英杰;刘月琴;李雪梅;李兰会;;反刍动物INHA基因编码区生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2014年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2014年

中国博士学位论文全文数据库 前5条

1 陈蕾;原始蛋白酶结构功能的生物信息学分析及化学基础[D];山东师范大学;2009年

2 苏志熙;几种哺乳动物表达序列标签（EST）生物信息学分析[D];浙江大学;2006年

3 赵佳媛;灵长类二氧化碳感知通路相关基因的进化及生物信息学分析[D];复旦大学;2010年

4 张晓娜;枳（Poncirus trifoliata）低温相关microRNAs鉴定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D];华中农业大学;2015年

5 马永平;含质粒人两歧双歧杆菌的分离、质粒测序和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2005年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨蓓;猪TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表达及生物信息学分析[D];石河子大学;2015年

2 孙萃萍;多房棘球绦虫HSP20蛋白的生物信息学分析、重组表达及泡球蚴的体外培养[D];兰州大学;2015年

3 郭磊磊;基于整合组学数据的胃癌生物信息学分析[D];郑州大学;2015年

4 张天海;果蝇miRNA-92a进化保守性及其靶基因功能的生物信息学分析[D];南京师范大学;2015年

5 张璐;苹果CAX基因家族生物信息学分析及sMdCAX1基因遗传转化的研究[D];南京农业大学;2014年

6 蒋圆圆;梭梭4个14-3-3蛋白基因的克隆及分析[D];新疆农业大学;2015年

7 杨朗;烟草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息学分析[D];四川农业大学;2015年

8 智倩;一株杆菌产脂肪酶基因的克隆及生物信息学分析[D];大连工业大学;2013年

9 张弘;博尔纳病病毒感染人少突胶质细胞差异microRNA表达和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2016年

10 陈晨;基于文献挖掘的前列腺癌蛋白组学差异表达蛋白的生物信息学分析[D];华北理工大学;2016年

，

本文编号：1151402