硬枝树花中非核糖体多肽合成酶NRPS基因的克隆与鉴定
发布时间:2017-11-16 21:18
本文关键词:硬枝树花中非核糖体多肽合成酶NRPS基因的克隆与鉴定
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【摘要】:以硬枝树花(Ramalina conduplicans)地衣型真菌为研究材料,采用简并引物扩增获得腺苷酰化结构域(A结构域),并以其为模板,通过Gene walking的方法获得非核糖体多肽合成酶(NRPSs)基因的全长,并对Rc NRPS基因进行生物信息学分析、分子系统进化分析及RT-PCR分析。Rc NRPS基因的开放阅读框总长3 150 bp,编码1 049个氨基酸残基。结构域分析显示:硬枝树花的NRPS基因含有腺苷酰化结构域(A结构域)、巯基化结构域(T结构域)、缩合结构域(C结构域)。将硬枝树花的Rc NRPS蛋白序列与曲霉属34条NRPS蛋白构建系统进化树,结果显示其为铁载体。生物信息学分析表明:NRPSs为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中。RT-PCR分析表明:酵母粉是Rc NRPS基因诱导表达所必需的,蔗糖可有效促进该基因的诱导表达。
【作者单位】: 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室;西南林业大学林学院;
【基金】:国家自然科学基金项目(31400488) 云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055) 云南省对外科技合作计划项目(2015IA004)共同资助
【分类号】:Q949.3
【正文快照】: Isolation and Identification of Nonribosomal Peptides Synthetases(NRPS)from Ramalina conduplicansYuan Xiaolong1Zhao Neng2Chen Jian1Wang Juan1Yang Yuming1Wang Yi1*1 Key Laboratory for Conservation of Rare,EndangerEndemic Forest Plants,State Forestry Admi
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1 王晗;王永;纪燕玲;王志伟;;NRPS基因在我国Epichlo(e|¨),Neotyphdium,Claviceps和Eurotium属真菌中分布的检测[A];中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会论文摘要集[C];2011年
,本文编号:1193723
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