泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析

发布时间：2017-11-18 14:01

  本文关键词：泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析

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【摘要】：[目的]通过克隆泰山螭霖鱼的COⅠ基因序列,研究其与鲤科几属鱼类的进化关系,确定泰山螭霖鱼的分类地位。[方法]以泰山螭霖鱼30个个体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的部分序列进行PCR扩增和序列对比,检测泰山螭霖鱼的遗传多样性;计算泰山螭霖鱼不同单倍型与Gen Bank中鲤科5个属鱼类的遗传距离,采用聚类分析方法,构建NJ和UPGMA系统进化树。[结果]30个个体泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因片段长度约1 600 bp,无碱基的插入和缺失,纯化并去除引物序列后获得约1 493 bp的核苷酸序列,存在6种单倍型,共检测到6个多态位点,包括4个转化、2个颠换,其单倍型多样性(Hd)为0.460,核苷酸多样性(Pi)为0.000 78,平均核苷酸差异数(K)1.163。遗传距离和NJ和UPGMA系统进化树表明,泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的COⅠ序列一致,泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近,与金线渻属、倒刺渻属、华鲮属的亲缘关系较远。[结论]该研究为其种质资源的管理与保护及遗传育种提供分子生物学依据。
【作者单位】： 山东省淡水水产遗传育种重点实验室农业部黄河下游渔业资源环境科学观测实验站山东省淡水渔业研究院;
【基金】：山东省农业良种工程项目“水产经济生物种质资源收集保护与评价”子课题三“淡水水产经济生物种质资源收集、保护与评价” 山东省现代农业产业体系鱼类创新团队项目(SDAIT-12-04)
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 泰山螭霖鱼(Varicorhinus sp.)属鲤科渻亚科突吻鱼属,是生活在泰山海拔270~800 m山涧溪流中的一种小型野生鱼类,其肉嫩味美、营养丰富,具有独特的药用保健价值[1],是泰山特有的珍贵生物,也是我国“五大贡鱼”之一[2]。对于泰山螭霖鱼的研究,自20世纪90年代起,鱼类学者们对其生

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3 王成武;泰山螭霖鱼精巢发育及性激素水平周年性变化的研究[D];山东农业大学;2004年

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本文编号：1200000