has-miR-16靶基因预测及生物信息学分析

发布时间：2017-11-21 04:10

  本文关键词：has-miR-16靶基因预测及生物信息学分析

  更多相关文章： 基因 计算生物学 预测

【摘要】：目的预测has-miR-16靶基因并对靶基因的分子功能、生物学过程和信号转导通路富集性分析,全面认识miR-16涉及的生命过程和疾病。方法通过阅读文献结合生物信息学预测的方法得出靶基因集合,用Cytoscape 3.2.1软件和DAVID(the database for annnotation visualization and integrated discovery)数据库分别对靶基因GO(gene ontology)注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号转导通路进行富集性分析。结果各物种已知的成熟miR-16序列具有高度保守性。397个靶基因在分子功能上显著富集于蛋白结合、DNA结合、酶类活性、胰岛素样生长因子受体活性等功能,在生物学过程显著富集于发育过程、细胞粘附、神经发生、细胞代谢和细胞周期调控等过程。靶基因显著富集的信号通路有癌症通路、p53信号通路、神经营养因子信号通路等通路。结论从分析结果得出has-miR-16通过调控靶基因参与了人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其在癌症的病理过程是一个值得进一步研究的方向。
【作者单位】： 南华大学公共卫生学院预防医学系;南华大学药学与生物科学学院生物学系;
【基金】：国家自然科学基金(81273026) 湖南省卫生厅科研基金(B2011-044)
【分类号】：R3416
【正文快照】： MicroRNA是一类在转录后水平调控基因表达的内生的、长度为20~24个核苷酸的非编码小RNA[1]。其作用途径为通过整合到RNA沉默复合物中,然后在哺乳动物体内基于与mRNA的3'非翻译区不完全匹配来调节靶基因表达[2]。miRNA通过调控靶基因表达的方式参与人类大部分的生物学过程和疾，

本文编号：1209619