犬γ-干扰素基因的克
本文关键词:犬γ-干扰素基因的克隆、序列分析及蛋白质结构预测
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【摘要】:根据Gen Bank上犬γ-干扰素基因(IFN-γ)序列(序列号WO318193),利用Primer 5.0软件设计特异性引物,应用RT-PCR技术从100μg/ml Con A刺激24 h后的犬外周血淋巴细胞总RNA中扩增出γ-干扰素基因,测序后应用DNAStar软件对克隆的犬γ-干扰素基因进行序列分析,并与Gen Bank上发表的犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠等的IFN-γ基因序列进行同源性比较。结果显示,克隆的犬IFN-γ基因大小501 bp,编码166个氨基酸,与犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠IFN-γ基因的核苷酸序列同源性分别为98.4%、81.6%、26.1%、26.1%、22.7%、22.7%、80.8%、81.0%、28.5%和25.0%;氨基酸序列同源性分别为95.8%、72.5%、5.4%、5.4%、6.6%、6.6%、68.9%、69.5%、5.4%和5.4%。运用DNAstar软件对犬γ-干扰素进行蛋白结构预测的结果显示,犬γ-干扰素蛋白含有10个α-螺旋、9个β-折叠、11个β-转角和5个无规则卷曲。
【作者单位】: 红河学院生命科学与技术学院;云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室;
【基金】:云南省科技厅应用基础研究面上项目(2010ZC151、2010CD088) 红河学院博士专项项目(XJ15B13)
【分类号】:S829.2
【正文快照】: 自661199)干扰素是在特定的诱导剂作用下,由细胞产生的一种具有高度生物学活性的糖蛋白质,它不仅具有Ⅰ型IFN(IFN-α、IFN-β)的抗病毒和抗肿瘤活性,还具有促进MHCⅡ抗原表达、增强APC细胞与T细胞的相互作用、增强T细胞辅助抗体产生和细胞毒性T细胞产生等诸多免疫调节活性[1-2
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,本文编号:1210877
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