当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因克隆和序列分析

发布时间：2017-11-24 00:13

  本文关键词：当归咖啡酸-O-甲基转移酶基因克隆和序列分析

  更多相关文章： 当归 咖啡酸-O-甲基转移酶 基因克隆 生物信息学分析 信号肽

【摘要】：目的克隆当归Angelica sinensis咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferases,COMT)编码基因全长c DNA,并对序列进行生物信息学分析。方法提取当归叶片总RNA为c DNA合成模板,利用同源克隆结合c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆当归COMT全长c DNA,并利用NCBI、Ex PASy网站上的Blast N、Blast P、ORF Finder、Compute PI/Mw、Prot Scale、PROSITE、SWISS-MODEL等序列在线分析工具和MEGA、DNAMAN生物信息学软件对序列进行分析。结果获得COMT全长c DNA序列,并在Gen Bank注册(登录号KP188587)。序列分析表明,克隆的c DNA全长为1 436 bp,其中包括5’-UTR(76 bp)和3’-UTR(362 bp),含有1个1 098 bp的完整开放阅读框(opening reading frame,ORF),编码365个氨基酸的多肽链;预测蛋白质相对分子质量为40 230,理论等电点(p I)为5.43;无信号肽,具有典型的II型氧甲基转移酶结构域SAM_OMT_II。结论首次克隆当归COMT基因全长c DNA,为当归COMT基因功能研究和当归阿魏酸生物合成与调控的机制研究奠定基础。
【作者单位】： 甘肃中医药大学;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81260616,81060327)
【分类号】：S567.239
【正文快照】： 当归Angelica sinensis(Oliv.)Diels是我国传统常用中药,味甘、辛,性温,归肝、心、脾经;具有补血活血、调经止痛、润肠通便等功效[1]。近年来由于当归引种区域扩大,栽培面积和产量持续增加以及全球气候变化等自然和人为因素的影响,当归药材品质面临着巨大挑战,开展品质形成相

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 谢广成;李丹彤;周立敬;;刺参甘露糖结合凝集素的生物信息学分析[J];生物技术通报;2011年02期

2 侯李君;王学魁;施定基;;蓝藻磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析[J];生物技术通报;2008年04期

3 李凤梅;;植物丝裂原活化蛋白激酶激酶的生物信息学分析[J];北方园艺;2010年03期

4 王汉屏;;不同植物防御素的生物信息学分析[J];植物生理学通讯;2008年01期

5 赵小峰;葛保健;;FoxA1蛋白的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2012年24期

6 孙桂荣;张虎;康相涛;陈其新;李红;王乐;;鸡miR-181a靶基因的生物信息学分析[J];河南农业科学;2011年05期

7 李鹏;饶灿;彭江;李想韵;宋锋;孙一铭;孙敏;;植物黄烷酮3-羟化酶的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2010年06期

8 魏琦超;畅丽萍;薛晓锋;周岩;;大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因的电子克隆及生物信息学分析[J];生物技术通报;2010年11期

9 程抒R，

本文编号：1220332