泰山螭霖鱼线粒体16S rRNA基因片段序列及分子系统发育分析

发布时间：2017-12-03 05:31

  本文关键词：泰山螭霖鱼线粒体16S rRNA基因片段序列及分子系统发育分析

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【摘要】：以泰山螭霖鱼(Varicorhinus macrolepis)30个个体为材料,对其线粒体16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和序列对比,检测了泰山螭霖鱼的遗传多样性;结合从GenBank中下载的同源性较高的鲤科7属部分鱼类的同源序列,利用MGEA软件计算遗传距离,采用聚类分析方法,构建了NJ和UPGMA系统进化树。结果显示:30个体泰山螭霖鱼线粒体16SrRNA基因片段长度为468bp,无碱基的插入和缺失,共检测到1个多态位点,存在2种单倍型,其单倍型多样性(Hd)为0.067,核苷酸多样性(Pi)为0.00015,平均核苷酸差异数(K)0.067。遗传距离和NJ、UPGMA系统进化树表明,泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的16SrRNA序列一致,泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近,与扁吻鱼属遗传距离最远。
【作者单位】： 山东省淡水水产遗传育种重点实验室 农业部黄河下游渔业资源环境科学观测实验站 山东省淡水渔业研究院;
【基金】：山东省农业良种工程项目 山东省现代农业产业体系鱼类创新团队项目(SDAIT-12-04)
【分类号】：S917.4
【正文快照】： 泰山螭霖鱼(Varicorhinus macrolepis)属鲤科渻亚科突吻鱼属,是生活在泰山海拔270~800m山涧溪流中的小型野生鱼类,其肉嫩味美、营养丰富,有独特的药用保健价值[1],是泰山特有的珍贵鱼类,为我国“五大贡鱼”之一[2]。自20世纪90年代起,鱼类学者们对生态习性和生物学特点[2]、人

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本文编号：1247636