草麻黄高通量转录组分析及黄酮类代谢途径相关基因的鉴定

发布时间：2017-12-05 13:38

  本文关键词：草麻黄高通量转录组分析及黄酮类代谢途径相关基因的鉴定

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【摘要】：草麻黄(Ephedra sinica Stapf)植物富含黄酮类和生物碱类化合物,具有重要药用价值,并且适应性强,在防风固沙、改善沙漠环境等方面具有重要作用。通过对已测序草麻黄转录组的原始数据进行重新组装、拼接等生物信息学分析,共得到7 947 954个clean reads,13 389条unigene序列。经过Nr,KOGs,GO,KEGG和Swiss-Prot等数据库分析后,获得10 481个Nr注释,4 533个KOG功能注释,7 121个GO功能注释,5 833个KEGG注释,8 039个Swiss-Prot注释,并利用KEGG通路分析技术发掘草麻黄中参与黄酮类化合物代谢途径相关基因,为克隆草麻黄黄酮合成关键基因、黄酮类化合物的生物合成提供重要的遗传资源,同时为其抗逆机制的研究和药用价值开发提供依据。
【作者单位】： 中国林业科学研究院林业研究所/国家林业局林木培育重点实验室;南京林业大学生物与环境学院;南宁树木园;
【基金】：林木遗传育种国家重点实验室专项(CAFYBB2012040) 国家自然科学基金资助项目(31270707)
【分类号】：S567.239
【正文快照】： 草麻黄(Ephedra sinica Stapf)属于麻黄科(Ephedraceae)麻黄属(Ephedra),是草本状灌木植物,属于超旱生、强旱生、旱生系列植物,根系发达,适应性强,四季常绿[1]。该属植物在防风固沙、增加植被覆盖等方面具有重要作用,是河西和西北荒漠地区的主要建群种[1]。麻黄属在我国有广泛

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本文编号：1255029