南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析

发布时间：2017-12-12 12:07

  本文关键词：南方红豆杉4个微卫星位点等位基因变异分析

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【摘要】：以南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)的4个微卫星位点为例,通过等位基因长度和序列变异分析,对各位点等位基因的变异特点、变异来源和进化关系进行研究。结果表明:这4个位点在南方红豆杉种内表现出丰富而复杂的变异特点,既有SSR重复区突变形成的等位基因,也有因侧翼序列插入/缺失(Indel)形成的等位基因,还存在同一长度形态的同形异源等位基因(allelic homoplasy),同时,在1个mt SSR位点中检测到了线粒体基因的异质性(heteroplasmy)。SSR重复序列和侧翼序列突变的共同作用是引起等位基因长度异常的主要原因。等位基因分布及其进化关系研究表明,4个位点的序列突变更符合逐步突变模型(SMM),常见等位基因在进化上具有原始性。
【作者单位】： 中南林业科技大学林学院;广西大学林学院;中南林业科技大学风景园林学院;广东省韶关市林业局;
【基金】：国家自然科学基金项目(36470666) 日本JSPS博士后研究员资助课题(11F00787) 林业公益性行业专项项目(201104033)
【分类号】：S791.49
【正文快照】： 长沙410004;4广东省韶关市林业局,广东韶关512000)遍存在于核基因组、线粒体和叶绿体基因组中,其突变率显著高于基因组其他序列(Schl?tterer,2000)。微卫星标记正是基于重复序列的高度变异性和侧翼序列的保守性而设计引物,在基因分型的基础上,通过基因型或等位基因频率进行相

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