葡萄SnRK2家族基因的鉴定与表达分析

发布时间：2017-12-21 07:32

  本文关键词：葡萄SnRK2家族基因的鉴定与表达分析　出处：《园艺学报》2016年10期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：以‘宝石无核’(Ruby Seedless)葡萄试管苗为材料,采用RT-PCR技术,克隆得到8个葡萄Sn RK2家族基因。序列分析发现,该家族基因蛋白结构在N端相对保守,而在C端极其特异;聚类结果表明葡萄Sn RK2基因家族可以分为3个亚家族;对这8个基因所编码的蛋白质进行分析发现,其富含酸性氨基酸,且均为亲水蛋白;基因组结构分析发现Vv Sn RK2.2和Vv Sn RK2.8含有10个外显子,其他6个均含9个外显子;对蛋白二级结构分析发现8个基因编码的蛋白主要以α 螺旋、β 转角和不规则卷曲为主;亚细胞定位预测,8个基因主要定位于细胞质中。顺式作用元件分析表明,除Vv Sn RK2.1、Vv Sn RK2.2、Vv Sn RK2.6外,其他基因顺式作用元件包含ABRE、DRE/CRT、LRTE中的一个或多个。定量PCR分析表明,Vv Sn RK2的表达存在组织差异性,Vv Sn RK2.7在根中表达水平最高,是叶片的3.8倍,Vv Sn RK2.8在茎中表达水平最高,是叶片的5.0倍。0~ 4℃处理后,表达水平下调幅度最小的为Vv Sn RK2.2,Vv Sn RK2.7下调幅度较大,Vv Sn RK2.8的表达水平为0;30℃处理后Vv Sn RK2.2和Vv Sn RK2.5上调表达,分别为对照的3.8倍和3.6倍;Vv Sn RK2.1和Vv Sn RK2.2与盐胁迫调节紧密相关,Vv Sn RK2.5与干旱胁迫调节密切相关。
【作者单位】： 甘肃农业大学园艺学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31460500)
【分类号】：S663.1
【正文快照】： Sn RK(蔗糖非发酵型蛋白激酶家族)是植物体内广泛存在的一类丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)类蛋白激酶,分为Sn RK1、Sn RK2和Sn RK3等3个亚家族(HalfordHardie,1998;Hrabak et al.,2003;Coello et al.,2012)。Sn RK1与酵母的SNF1和哺乳动物的AMPKs同源,并且具有高度保守的N端催化结

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