草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析

发布时间：2017-12-23 18:29

  本文关键词：草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析　出处：《沈阳农业大学学报》2016年02期 　论文类型：期刊论文

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【摘要】：micro RNA(miRNA)是来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,在转录后水平上负调控基因表达,在植物的生长发育和胁迫应答等方面起重要作用。以栽培草莓艳丽为试材,利用RT-PCR技术克隆草莓叶片中5种新miRNA的前体及靶基因,分析靶基因的结构特征与功能,结果表明:草莓mi R-6,mi R-12,mi R-13,mi R-14,mi R-29的前体长度分别为513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的茎环结构,其中mi R-12、mi R-13的成熟miRNA序列在茎环3'端臂上,mi R-6、mi R-14、mi R-29成熟miRNA序列在茎环的5'端臂上。mi R-14与mi R-29的靶基因分别为854bp和690bp,与森林草莓基因组对应序列一致性为98.72%和99.42%,其中mi R-29靶基因是GRP基因,编码143个氨基酸,推测mi R-29靶基因在草莓植株的胁迫响应中有重要调控作用。本研究丰富了草莓miRNA的研究,为揭示草莓miRNA的生物学功能奠定基础。
【作者单位】： 辽宁省农业科学院蔬菜研究所;沈阳农业大学园艺学院/设施园艺省部共建教育部重点实验室;
【基金】：辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划项目(LJQ2014069) 国家自然科学基金项目(31101524)
【分类号】：S668.4
【正文快照】： micro RNA(mi RNA)是生物体中普遍存在的一种内源性非编码小分子RNA,长度多数在21~24 nt[1]。mi RNA在植物器官生长发育,激素信号转导,细菌、病毒侵染及其他非生物胁迫等过程中均起重要作用[2-4]。植物mi R-NA是由mi RNA基因在RNA聚合酶Ⅱ的作用下形成原初转录产物(Pri-mi RNA

【参考文献】

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3 刘宗旨,王建龙,王群,黄勋,徐卫辉,朱立煌,何平,方荣祥;Structure, expression pattern and chromosomal localization of the rice Osgrp-2 gene[J];Science in China(Series C:Life Sciences);2003年06期

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【共引文献】

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5 陈璇;曾千春;张家瑞;胡尊红;李文正;;烟草属RGP-3基因克隆及多样性分析[J];西南农业学报;2014年03期

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9 李敬涛;余刚;陈宣明;范臻;刘金亮;潘洪玉;;四翅滨藜AcDHN基因的克隆及其抗逆功能分析[J];植物生理学报;2012年07期

10 陈宗瑜;毕婷;吴潇潇;;滤减UV-B辐射对烤烟蛋白质组变化的影响[J];生态学杂志;2012年05期

【二级参考文献】

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2 ;Characterization and Expression Analysis of Four Glycine-Rich RNA-Binding Proteins Involved in Osmotic Response in Tobacco (Nicotiana tabacum cv. Xanthi)[J];Agricultural Sciences in China;2010年11期

3 潘妍;王玉成;张大伟;杨传平;;二色补血草LbGRP基因的克隆及抗逆能力分析[J];遗传;2010年03期

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本文编号：1325025