甜瓜WRKY转录因子家族基因生物信息学分析

发布时间：2018-01-27 07:53

  本文关键词： 甜瓜 生物信息学 WRKY转录因子 进化分析　出处：《基因组学与应用生物学》2017年11期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：WRKY转录因子是一类重要的调控分子,在高等植物中以基因家族的形式存在。本研究以甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据为材料,利用生物信息学手段对WRKY转录因子家族成员、系统进化、基因分类、保守基序(motif)的保守性进行预测和分析。研究表明,甜瓜WRKY家族包含61个基因,其中13个含有2个WRKY结构域和C_2H_2锌指型结构归为第Ⅰ类,43个含有1个WRKY结构域和C_2H_2锌指型结构的归为第Ⅱ类,5个含有1个WRKY结构域和C2HC锌指型结构的归为第Ⅲ类。
[Abstract]:WRKY transcription factors are a kind of important regulatory molecules, which exist in the form of gene family in higher plants. In this study, the genomic data of Cucumis melo L.were used as materials. Bioinformatics was used to predict and analyze the conservatism of WRKY transcription factor family members, phylogeny, gene classification and conserved motif. The WRKY family of muskmelon contains 61 genes, of which 13 contain two WRKY domains and the zinc finger structure of Cs _ 2H _ 2S _ 2 is classified into class 鈪，

本文编号：1468002