鸭源大肠杆菌Ⅰ型菌毛的鉴定及FimA、FimH基因特征分析

发布时间：2018-02-01 19:20

  本文关键词： 大肠埃希菌 Ⅰ型菌毛 氨基酸 序列比对 抗原表位　出处：《浙江农业学报》2017年12期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为了解川渝部分地区鸭源大肠埃希菌Ⅰ型菌毛产生情况及分子特征,采用MSHA/MRHA试验、PCR扩增Ⅰ型菌毛基因(FimA、FimH)进行菌毛类型鉴定;通过分析FimA氨基酸序列的亲水性、抗原性、表面可及性来预测抗原位点。MSHA/MRHA试验结果显示,MSHA检测阳性率为44.3%;PCR检测FimA阳性率为63.41%,FimH阳性率为100%。氨基酸序列比对结果显示:FimA氨基酸序列与比对株大肠埃希菌(ECOR61)相比,存在19个差异位点;FimH氨基酸序列与比对株(ECOR45)相比,仅少数菌株出现1~2个氨基酸位点差异,表明该片段高度保守。对FimA氨基酸序列进行抗原位点预测,结果显示,多数菌株抗原表位共同区域分布在84~88、142~146、149~150位氨基酸之间,除上述位点外,部分菌株在101~105、130~134位氨基酸出现抗原表位。
[Abstract]:In order to understand the production and molecular characteristics of Escherichia coli type I pili from ducks in Sichuan and Chongqing regions, the type 鈪，

本文编号：1482669