滇龙胆香叶醇-10-羟化酶基因克
本文关键词： 滇龙胆 香叶醇-羟化酶 基因克隆 生物信息学 基因表达 出处：《中草药》2017年03期 论文类型：期刊论文
【摘要】：目的克隆滇龙胆Gentiana rigescens香叶醇-10-羟化酶(geraniol-10-hydroxylase,G10H)基因,对其进行定量表达以及生物信息学分析。方法采用PCR技术获得G10H的c DNA序列,对G10H蛋白进行理化性质、二级结构和三级结构等生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR方法检测G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中的表达情况。结果克隆得到滇龙胆G10H基因,全长为1 400 bp,ORF 1 248 bp,编码415个氨基酸。生物信息学预测该基因编码蛋白质分子式为C_(2131)H_(3390)N_(586)O_(615)S_(17),等电点为7.62,不稳定系数为44.20,疏水性系数GRAVY为-0.245。G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中均有表达,其中在根中表达量最高,茎中最低。结论首次从滇龙胆中克隆得到了G10H基因,为进一步阐明该基因的羟基化功能在滇龙胆龙胆苦苷生物合成途径中的重要作用奠定基础。
[Abstract]:Objective to clone and express the geraniol-10-hydroxylase G10H gene of Gentiana rigescens and analyze its bioinformatics. Methods the c DNA sequence of G10H was obtained by PCR, and the physicochemical properties of G10H protein were obtained. The expression of G10H gene in root, stem and leaf of Dian Gentiana was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. The total length is 1 400 BP ORF 1 248 BP, encoding 415 amino acids. Bioinformatics predicts that the molecular formula of the protein encoded by this gene is CX 2131 HX 3390 NSP, isoelectric point 7.62, instability coefficient 44.20, hydrophobicity coefficient GRAVY -0.245 G10H expressed in root, stem and leaf of Gentiana yunnanensis. Conclusion the G10H gene was cloned from Gentiana davidiana for the first time, which laid a foundation for further elucidating the important role of Gentiopicrin in the biosynthesis pathway of Gentiopicrin.
【作者单位】： 云南中医学院中药学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81660634) 云南省科技计划项目(2014FZ077) 云南省教育厅重点项目(2013Z002) 云南省应用基础研究-中医联合专项[2015FB205(-024)]
【分类号】：S567.239;Q943.2
【相似文献】
相关期刊论文 前10条
1 陈晓华;蔡国平;;人致肺纤维化相关因子的克隆和生物信息学分析[J];生物化学与生物物理进展;2006年07期
2 王锐;赵跃;张永云;李卫真;王淑燕;霍海龙;刘丽仙;苗永旺;霍金龙;;猪胰岛素样生长因子-Ⅰ的克隆及生物信息学分析[J];西南农业学报;2014年02期
3 谭从娥;王米渠;冯文哲;徐全壹;;生物信息学分析寒证海量数据的探索[J];中华中医药学刊;2008年12期
4 程勇前;成军;刘妍;王琳;徐东平;钟彦伟;曲建慧;赵平;;钙离子调节亲环素配体及其不同剪接体的克隆及生物信息学分析[J];医学研究生学报;2008年05期
5 卢雪梅;金小宝;朱家勇;沈娟;梅寒芳;马艳;肖明珠;褚夫江;;人溶菌酶基因的克隆和生物信息学分析[J];生物技术;2010年06期
6 牛伟涛;;家蚕中一未知基因的生物信息学分析[J];邢台学院学报;2011年02期
7 胡甘雨;司风玲;车燕飞;张玉娟;陈斌;;葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J];西南大学学报(自然科学版);2014年01期
8 杨向东,王仁,刘俊文,唐蔚青,李红霞,王抒;一个新的人突触相关蛋白基因的生物信息学分析[J];中国动脉硬化杂志;2004年01期
9 张艳宇,马平,陆一鸣,吕丽萍,姜升阳,周锡鹏,孙树汉,许金波;尖吻蝮蛇类凝血酶基因的克隆及生物信息学分析[J];中国实验血液学杂志;2005年04期
10 张孝勇;崔光彬;杜滂;马克军;王亚蓉;韩苇;颜真;张英起;魏经国;;兔大电导钙敏感性钾离子通道β亚基的克隆及生物信息学分析[J];第四军医大学学报;2007年09期
相关会议论文 前10条
1 焦斐;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;丁学智;褚敏;吴晓云;刘建;;牛FAS基因的生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年
2 唐爱发;余振东;桂耀庭;郭新;李贤新;周锦堂;朱辉;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表达及其生物信息学分析[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年
3 刘惠君;谭宇蓉;刘持;向阳;屈飞;秦晓群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息学分析及功能研究[A];湖南省生理科学会2008年度学术年会论文摘要汇编[C];2008年
4 黄浩;陆启轩;陈临溪;杨莉;毛小环;李兰芳;秦旭平;曹建刚;;APJ受体的生物信息学分析[A];全国第十二届生化与分子药理学学术会议论文集[C];2011年
5 陈大清;吴功庆;李亚男;;淹水胁迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息学分析[A];2005'海峡两岸植物生理与分子生物学教学研讨会论文集[C];2005年
6 田琪琳;施定基;贾晓会;王晓燕;黄希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息学分析[A];中国藻类学会第八次会员代表大会暨第十六次学术讨论会论文摘要集[C];2011年
7 陈玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭锡熔;;miR-146b靶基因预测和生物信息学分析[A];2012年江浙沪儿科学术年会暨浙江省医学会儿科学分会学术年会、儿内科疾病诊治新进展国家级学习班论文汇编[C];2012年
8 苑赞;赵锦;刘孟军;;枣花粉过敏原Zizj1基因的克隆与生物信息学分析[A];第八届全国干果生产、科研进展学术研讨会论文集[C];2013年
9 王玲;高莲;李健;赖松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息学分析[A];第五届中国畜牧科技论坛论文集[C];2011年
10 李婷;张英杰;刘月琴;李雪梅;李兰会;;反刍动物INHA基因编码区生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2014年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2014年
相关博士学位论文 前5条
1 陈蕾;原始蛋白酶结构功能的生物信息学分析及化学基础[D];山东师范大学;2009年
2 苏志熙;几种哺乳动物表达序列标签（EST）生物信息学分析[D];浙江大学;2006年
3 赵佳媛;灵长类二氧化碳感知通路相关基因的进化及生物信息学分析[D];复旦大学;2010年
4 张晓娜;枳（Poncirus trifoliata）低温相关microRNAs鉴定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D];华中农业大学;2015年
5 马永平;含质粒人两歧双歧杆菌的分离、质粒测序和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2005年
相关硕士学位论文 前10条
1 杨蓓;猪TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表达及生物信息学分析[D];石河子大学;2015年
2 孙萃萍;多房棘球绦虫HSP20蛋白的生物信息学分析、重组表达及泡球蚴的体外培养[D];兰州大学;2015年
3 郭磊磊;基于整合组学数据的胃癌生物信息学分析[D];郑州大学;2015年
4 张天海;果蝇miRNA-92a进化保守性及其靶基因功能的生物信息学分析[D];南京师范大学;2015年
5 张璐;苹果CAX基因家族生物信息学分析及sMdCAX1基因遗传转化的研究[D];南京农业大学;2014年
6 蒋圆圆;梭梭4个14-3-3蛋白基因的克隆及分析[D];新疆农业大学;2015年
7 杨朗;烟草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息学分析[D];四川农业大学;2015年
8 智倩;一株杆菌产脂肪酶基因的克隆及生物信息学分析[D];大连工业大学;2013年
9 张弘;博尔纳病病毒感染人少突胶质细胞差异microRNA表达和生物信息学分析[D];重庆医科大学;2016年
10 陈晨;基于文献挖掘的前列腺癌蛋白组学差异表达蛋白的生物信息学分析[D];华北理工大学;2016年
，本文编号：1504961
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/1504961.html
