谷子蔗糖合成酶基因家族鉴定及生物信息学分析

发布时间：2018-02-14 19:45

  本文关键词： 谷子 蔗糖合成酶 SiSuS基因 生物信息学分析 蛋白结构　出处：《江苏农业科学》2017年15期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：蔗糖合成酶(sucrose synthase,SuS)是蔗糖代谢的关键酶,在植物的代谢反应中起重要作用。以谷子基因组数据库为平台,借用生物信息学手段对谷子SiSuS基因家族进行挖掘和分析。结果表明,谷子的SiSuS基因家族包括9个基因,它们不均匀地分布在5条染色体上。该家族氨基酸序列长度为809~1 088 aa,外显子数目为10~16个,大多数蛋白质为弱酸性。谷子SiSuS的氨基酸序列具有9个保守基序;进化树分析结果表明,谷子、水稻、高粱SiSuS蛋白聚在一起。
[Abstract]:Sucrose synthase Sus is the key enzyme of sucrose metabolism and plays an important role in plant metabolic response. The SiSuS gene family of millet was excavated and analyzed by bioinformatics on the platform of millet genome database. The SiSuS gene family of millet consists of 9 genes, which are unevenly distributed on 5 chromosomes. The amino acid sequence of the family is 809 (1088aa) and the number of exons is 10 ~ 16. Most of the proteins were weakly acidic. The amino acid sequences of millet SiSuS had 9 conserved motifs, and the results of evolutionary tree analysis showed that the SiSuS proteins of millet, rice and sorghum were clustered together.
【作者单位】： 河北北方学院;河北省沽源县农牧局;河北省农林科学院谷子研究所;
【基金】：国家科技重大专项(编号:2014ZX0800909B) 河北省科技厅项目(编号:16226310D) 河北北方学院重大项目(编号:ZD201305)
【分类号】：S515

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本文编号：1511466