砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析

发布时间：2018-02-15 11:30

  本文关键词： 砀山酥梨 TCP基因家族 全基因组鉴定 进化分析　出处：《基因组学与应用生物学》2017年02期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：TCP蛋白是植物特有的转录因子家族之一,在植物生长和发育等多个过程起到重要作用。本研究利用生物信息学方法对砀山酥梨TCP基因家族成员、染色体定位、进化分析、亚组分类、保守域结构和保守元件进行了相关分析。结果显示,梨TCP基因家族含有34个成员;进化分析表明,根据进化树拓扑结构将其分为两类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可被分为CYC/TB1和CIN两个小组。结构域分析表明,梨TCP基因家族TCP结构域高度保守;保守元件分析表明,梨TCP基因家族包含5个保守元件:元件1是TCP保守域;元件2为R结构域,元件3、4和5为功能尚未鉴定的结构域,所有梨TCP蛋白都含有元件1,ClassⅡ组中CYC/TB1小组包含特异元件2。以上结果将为今后揭示梨TCP基因的功能提供重要的理论基础。
[Abstract]:TCP protein is one of the plant specific transcription factor families, which plays an important role in plant growth and development. In this study, TCP gene family members, chromosomal location and evolutionary analysis of Dangshan pear were studied by bioinformatics. The subgroup classification, conserved domain structure and conservative elements were analyzed. The results showed that the pear TCP gene family had 34 members, and the evolutionary analysis showed that it was divided into two classes: class 鈪，

本文编号：1513163