中华猕猴桃‘红阳’Alase家族基因的克隆及表达分析
本文关键词: 醛糖酸内酯酶 抗坏血酸 生物信息学分析 基因表达分析 出处:《应用与环境生物学报》2017年02期 论文类型:期刊论文
【摘要】:在高等植物中醛糖酸内酯酶(Alase)催化L-半乳糖酸(L-Gal A)形成抗坏血酸(Ascorbic acid,As A)的前体物质L-半乳糖-1,4-内酯(L-Ga IL),是As A合成分支途径D-半乳糖醛酸途径中的关键步骤.基于最新的猕猴桃基因组数据库,分离并克隆到3个Alase家族基因,分别命名为Alase1、Alase2、Alase3,并从基因信息、蛋白质理化性质、二级结构及序列特征方面对其进行预测及分析.结果表明,Alase为亲水性蛋白,二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主,3个Alase基因具有高度的相似性.定量RT-PCR分析表明3个Alase家族基因在不同组织中均有表达,且在成熟的叶片中表达量最高.同时在猕猴桃果实发育及成熟过程中,Alase家族基因在幼果中的表达水平较低,而在果实发育后期及果实成熟过程中表达量不断升高.本研究可为Alase家族基因后续功能研究及猕猴桃中As A生物合成和积累分子机制解析奠定基础.
[Abstract]:The formation of Ascorbic acid ascorbic acid (Ascorbic acidas) as a precursor of Alasease catalyzed by Alasease in higher plants is a key step in the Dgalacturonic acid pathway, which is a branch pathway of as A synthesis. In the latest kiwifruit genome database, Three Alase family genes were isolated and cloned. They were named Alase1, Alase2 and Alase3, and were predicted and analyzed from the aspects of gene information, protein physicochemical properties, secondary structure and sequence characteristics. The results showed that Alase was a hydrophilic protein. The secondary structure was mainly 伪 -helix and irregular crimp, and the three Alase genes were highly similar. Quantitative RT-PCR analysis showed that the three Alase family genes were all expressed in different tissues. At the same time, the expression level of Alase family genes in young fruit was lower during the development and maturation of kiwifruit. This study can be used to study the gene function of Alase family and explain the molecular mechanism of as A biosynthesis and accumulation in Actinidia deliciosa.
【作者单位】: 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 水力学与山区河流开发保护国家重点实验室;合肥工业大学生物与食品工程学院;
【基金】:国家973计划重大项目(2011CB100401)资助~~
【分类号】:Q943.2;S663.4
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,本文编号:1549568
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