黄瓜单性结实候选基因预测与表达分析
本文选题：黄瓜 切入点：单性结实 出处：《核农学报》2016年02期 论文类型：期刊论文
【摘要】：为发掘黄瓜单性结实基因并通过表达分析预测相关基因的功能,以黄瓜单性结实性状QTL定位结果为基础,对主效QTL区段内的基因进行生物信息学分析,发现118个基因与细胞周期、细胞生长以及激素信号传导等生物学过程有关。结合黄瓜单性结实转录组研究结果,共筛选出10个在黄瓜单性结实过程中转录水平有剧烈变化的基因。利用q RT-PCR技术分析这些基因在授粉、未授粉及单性结实的黄瓜果实发育过程中的转录变化,结果表明,Cs CRT1、Cs LON、Cs TRAPPC4、Cs RABEPK和Cs POT基因在单性结实坐果过程中特异性的上调表达,Cs5NG4基因在单性结实和授粉结实过程中呈相反表达趋势,因此推测这6个基因为黄瓜单性结实候选基因。本研究为进一步利用候选基因资源改良现有黄瓜栽培品种的单性结实性奠定了基础。
[Abstract]:In order to explore the parthenocarpy genes of cucumber and predict the function of related genes by expression analysis, based on the results of QTL mapping of parthenocarpy traits in cucumber, bioinformatics analysis of genes in the main effect QTL region was carried out. It was found that 118 genes were related to cell cycle, cell growth and hormone signal transduction. A total of 10 genes were screened out which changed dramatically during parthenocarpy. Q RT-PCR technique was used to analyze the transcriptional changes of these genes during the development of pollinated, unpollinated and parthenocarpic cucumber fruits. The results showed that the expression of Cs5NG4 gene in parthenocarpy and pollination was reverse during parthenocarpy and fruiting. The results showed that Cs5NG4 RABEPK and Cs POT genes were up-regulated specifically during parthenocarpy and pollination, and the expression of Cs5NG4 gene was reversed during parthenocarpy and pollination. Therefore, we speculated that these 6 bases were candidate genes for parthenocarpy in cucumber. This study laid a foundation for further improvement of parthenocarpy of existing cucumber cultivars by using candidate gene resources.
【作者单位】： 南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室;
【基金】：国家重点基础研究发展计划“973”项目(2012CB113904) 农业部行业专项(201403032) 国家自然基金青年基金(31301781)
【分类号】：S642.2
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，本文编号：1565882
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