锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物cp基因序列分析

发布时间：2018-03-14 04:14

  本文选题：蜀葵　切入点：锦葵脉明病毒　出处：《植物病理学报》2017年04期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)和非序列依赖性PCR扩增技术(sequence-independent amplification,SIA)对表现出条斑症状的感病蜀葵进行了病原鉴定,结果发现侵染蜀葵的病原为锦葵脉明病毒(Malva vein clearing virus,MVCV),这是锦葵脉明病毒在国内首次报道。为进一步明确锦葵脉明病毒中国蜀葵分离物(MVCV-AR)的来源及进化关系,克隆获得其外壳蛋白(coat protein,cp)基因(Gen Bank登录号为KX619649)。通过与其他MVCV分离物的核苷酸及氨基酸序列比对分析可知,MVCV-AR与Mexico的tomato分离物(FJ561293)的核苷酸同源性最高为90.5%;与来自Italy的DS-Ba-01分离物(FM 212972)的氨基酸同源性最高为98.3%。系统进化分析表明,MVCV-AR与DS-Ba-01分离物聚为一簇,形成独立的分支。
[Abstract]:In this study, double-stranded RNA(double-stranded RNA-dsRNAs and sequence-independent amplification of PCR were used to identify the pathogeny of susceptible hollyhock. The results showed that the pathogen of the infection was Malva vein clearing virusus (MVCVV), which was the first reported in China. The nucleotide sequence of the coat coat protein cp) gene was identified as KX6196491.The nucleotide and amino acid sequences of MVCV-AR and Mexico's tomato isolate FJ561293) were compared with that of other MVCV isolates. The highest nucleotide homology was 90.5% with that of tomato isolate FJ561293 from Italy. The amino acid homology of DS-Ba-01 isolate FM 212972 was 98.3.The phylogenetic analysis showed that MVCV-AR and DS-Ba-01 isolate were clustered together. Form an independent branch.
【作者单位】： 山西农业大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31540050) 公益性行业(农业)科研专项(201303028)
【分类号】：S432.41

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：1609560