蓖麻矮化相关基因RcDof的克隆及分析

发布时间：2018-03-14 23:21

  本文选题：蓖麻矮化　切入点：基因克隆　出处：《华北农学报》2016年04期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为研究Rc Dof基因在蓖麻矮化中的作用及生物学功能,提取蓖麻生长跃变期茎尖中基因组DNA,根据蓖麻中已获得的锌指蛋白基因片段设计引物,采用RACE技术克隆得到该基因,基因完整阅读框全长为924 bp,可编码307个氨基酸,为C2C2型锌指蛋白,预测蛋白质分子量为34.020 9 k Da,等电点为9.23。二级结构预测表明α螺旋占1.63%,β折叠占1.30%,其他无规则卷曲占97.07%,为外释放蛋白。亚细胞定位于细胞核中,对Rc Dof基因的生物信息学分析为进一步研究其在蓖麻矮化过程中的作用机制和功能特征提供理论依据。
[Abstract]:In order to study the role and biological function of RC Dof gene in the dwarfing of castor, genomic DNAs were extracted from the stem tip of castor castor during the growth jump period. Primers were designed according to the zinc finger protein gene fragment obtained from castor. The gene was cloned by RACE technique. The complete reading frame is 924 BP and encodes 307 amino acids, which are C2C2 zinc finger protein. The predicted molecular weight of protein is 34.0209kDa, the isoelectric point is 9.23.The secondary structure prediction shows that 伪 helix is 1.63, 尾 folding is 1.30, other irregular curl is 97.07, the subcell is located in the nucleus. The bioinformatics analysis of RC Dof gene provides a theoretical basis for further study on the mechanism and functional characteristics of RC Dof gene in the process of ricin dwarfing.
【作者单位】： 内蒙古民族大学生命科学学院;内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心;内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室;内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心;内蒙古民族大学农学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31460353) 2015年全区研究生科研创新资助项目(S20151013601) 内蒙古民族大学市校合作项目(SXZD2012006;SXZD2012017) 内蒙古自治区科技创新引导资金项目(KJCX15002) 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心项目 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目(MDK2016030)
【分类号】：S565.6

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本文编号：1613412