泥蚶胰岛素生长因子1受体基因的cDNA全长克隆及表达分析

发布时间：2018-03-20 13:02

  本文选题：泥蚶　切入点：Tg-IGFR基因　出处：《水产学报》2017年01期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为了研究IGF1R基因在泥蚶生长、发育过程中的调控作用,本研究基于泥蚶转录组文库的EST,利用SMART RACE技术首次克隆获得泥蚶IGF1R基因(Tg-IGF1R)c DNA全长序列,该序列全长为5793 bp,开放阅读框为4638 bp,编码1546个氨基酸。经生物信息学分析发现,该基因5′端非编码区为810 bp,3′端非编码区为345 bp,Tg-IGF1R蛋白分子量为176.01 ku,等电点为6.04,包含4个Ⅲ型纤粘连蛋白结构域,1个半胱氨酸富集区和1个酪氨酸激酶结构域,属于亲水性跨膜蛋白质。氨基酸多重比对显示Tg-IGF1R蛋白序列与人、非洲爪蟾、斑马鱼的相似性分别为45.2%、45.6%和45.4%。利用q RT-PCR技术检测了Tg-IGF1R基因在泥蚶成体不同组织及幼体不同发育时期的表达情况,发现该基因具有广泛的组织表达性,在所检测的6个组织(血液、闭壳肌、斧足、鳃、内脏团和外套膜)中均有不同程度的表达,其中血液中的相对表达量最高,并与其余5个组织间存在显著性差异,推测Tg-IGF1R以信号分子的形式参与多种组织细胞的生命过程。Tg-IGF1R基因在泥蚶个体发育过程中的9个时期均有表达,且高表达主要集中在原肠胚期,其次是担轮幼虫期和稚贝期,说明Tg-IGF1R基因可能在早期发育阶段参与了某些器官的形成。
[Abstract]:In order to study the role of IGF1R gene in the growth and development of clam clams, the full-length sequence of IGF1R gene Tg-IGF1RG DNA was first cloned by SMART RACE based on the transcriptional library of Clonarca subcrenata. The total length of the sequence is 5793 BP, and the open reading frame is 4638 BP, encoding 1546 amino acids. The 5 '-terminal noncoding region of the gene is 810 BP ~ (3'). The molecular weight of the protein is 176.01 ku. the isoelectric point is 6.04. The protein contains four type 鈪，

本文编号：1639190