高粱抗丝黑穗病基因SRAP体系优化
本文选题:高粱 切入点:SRAP-PCR 出处:《分子植物育种》2017年02期
【摘要】:为建立高粱抗丝黑穗病基因最佳的SRAP-PCR反应体系,进一步筛选与抗病基因相关的SRAP标记。本研究采用单因素与正交设计相结合的方法,对影响高粱SRAP-PCR体系的5个因素Taq酶、Mg2+、模板DNA、d NTPs和引物进行优化,以期筛选出最优的高粱抗丝黑穗病基因SRAP-PCR反应体系。研究表明:在优化得到的20μL的高粱SRAP-PCR体系中,模板DNA的用量为20.0 ng,Taq DNA聚合酶的用量为0.14 U,Mg2+的浓度为3.0 mmol/L,d NTPs浓度为0.3 mmol/L,引物的浓度为0.5μmol/L。各因素对反应体系影响大小依次为:引物浓度DNA用量Taq DNA聚合酶浓度Mg2+浓度=d NTPs浓度。本研究将为高粱抗性基因的定位与功能研究提供基础数据与技术支持。
[Abstract]:In order to establish the best SRAP-PCR reaction system of sorghum resistance to head smut gene and to screen the SRAP marker related to resistance gene, the single factor and orthogonal design were used to study the effect of Taq enzyme Mg2 on sorghum SRAP-PCR system. The template DNA-d NTPs and primer were optimized to screen the optimal SRAP-PCR reaction system of sorghum smut resistance gene. The results showed that in the optimized 20 渭 L sorghum SRAP-PCR system, The dosage of template DNA was 20.0 ng / g Taq DNA polymerase 0.14 渭 mol / L NTPs was 0.3 mmol / L and primer concentration was 0.5 渭 mol / L. the effect of each factor on the reaction system was as follows: DNA concentration, Taq DNA polymerase concentration, Mg2 concentration. This study will provide basic data and technical support for the mapping and functional study of sorghum resistance genes.
【作者单位】: 山西农业大学农学院;山西省农业科学院生物技术研究中心;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;
【基金】:山西省科技攻关项目(20140311003-4);山西省科技攻关项目(20130311004-3) 山西省财政支农项目(2015TGSF-10) 国家公益性行业(农业)科研专项(201503121-07)共同资助
【分类号】:S435.14;Q943.2
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,本文编号:1683353
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