刺五加法尼基焦磷酸合酶、鲨烯合酶、鲨烯环氧酶基因启动子CpG岛的预测与功能验证

发布时间：2018-04-02 13:22

  本文选题：刺五加　切入点：启动子　出处：《中草药》2017年24期

【摘要】：目的获得刺五加法尼基焦磷酸合酶(FPS)、鲨烯合酶(SS)、鲨烯环氧酶(SE)基因启动子的CpG岛分布情况和功能活性。方法针对已克隆的FPS、SS、SE基因启动子序列,使用EMBOSS和Li Lab进行CpG岛预测,同时利用GUS基因作为报告基因,p CAMBIA1301质粒作为表达载体,利用根癌农杆菌转化拟南芥进行功能验证。结果发现刺五加FPS、SS启动子含有2个CpG岛,长度分别是520、218 bp和108、103 bp,SE启动子含有3个CpG岛,长度为290、119、149 bp。FPS、SS、SE基因启动子均具有启动活性,但强度不一,SS启动子活性最强。结论研究首次获得刺五加FPS、SS、SE基因启动子区域的CpG岛分布情况,以及其功能活性,为后续进一步FPS、SS、SE甲基化分析及其在刺五加中的表达调控研究奠定了基础。
[Abstract]:Objective to obtain the CpG island distribution and functional activity of the promoter of FPS, squalene synthase, squalene cyclooxygenase SE) gene of Acanthopanax senticosus. Methods the CpG island was predicted by EMBOSS and Li Lab. At the same time, GUS gene was used as the expression vector of the reporter gene, and Agrobacterium tumefaciens was transformed into Arabidopsis thaliana for functional verification. The results showed that the FPSSS promoter of Acanthopanax senticosus contained two CpG islands. The length of 520218 BP and 108103 BP of the SE promoter contained three CpG islands, and the length of 290119149 BP. Conclusion the distribution of CpG island and its functional activity in the promoter region of FPS SSS SE gene of Acanthopanax senticosus were obtained for the first time. The results laid a foundation for the further study on the methylation of FPSG SSSE and its expression regulation in Acanthopanax senticosus (Acanthopanax senticosus).
【作者单位】： 华北理工大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31570683) 华北理工大学培育基金资助项目(SP201508);华北理工大学研究生创新项目(2017S12)
【分类号】：S567.19

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本文编号：1700583