珙桐转录因子DiMYB1基因的生物信息学分析

发布时间：2018-04-02 23:33

  本文选题：DiMYB　切入点：珙桐　出处：《北方园艺》2017年02期

【摘要】：利用生物信息学方法对前期通过转录组测序获得的珙桐DiMYB1基因编码蛋白序列进行分析,为后续DiMYB1基因的功能鉴定和调控研究奠定基础。结果表明:DiMYB1蛋白全长924bp,编码307个氨基酸,相对分子量为35kDa,为亲水性蛋白。DiMYB1属于R2R3-MYB蛋白家族,含有1个信号肽结构和2个功能结构域,亚细胞定位预测该基因位于细胞核的可能性是91.3%。系统进化树分析表明,其与柿树MYB2转录因子的同源性最高,相似度为84%。
[Abstract]:Bioinformatics was used to analyze the coding protein sequence of DiMYB1 gene of Davidia involucrata by transcriptional sequencing, which laid a foundation for the functional identification and regulation of DiMYB1 gene.The results showed that the total length of the protein was 924 BP, encoding 307 amino acids, and the relative molecular weight was 35 kDa.DiMYB1 was a hydrophilic protein belonging to the R2R3-MYB family, which contained a signal peptide structure and two functional domains.The possibility of subcellular localization predicting that the gene is located in the nucleus is 91. 3%.Phylogenetic tree analysis showed that it had the highest homology with MYB2 transcription factors and the similarity was 84%.
【作者单位】： 中南林业科技大学生命科学与技术学院;
【基金】：中南林业科技大学博士后科研基金资助项目(0490016);中南林业科技大学青年基金资助项目(QJ201512)
【分类号】：S792.99

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 胡甘雨;司风玲;车燕飞;张玉娟;陈斌;;葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J];西南大学学报(自然科学版);2014年01期

2 姚杨;黄原;苏杰;;东亚三角涡虫Rab蛋白cDNA序列的克隆与生物信息学分析[J];生物技术通报;2012年02期

3 张媛;张钟仁;咸丽霞;邢国芳;;玉米谷胱甘肽过氧化物酶生物信息学分析[J];山西农业科学;2013年08期

4 晁哲;林哲敏;刘海隆;张星;郑心力;黄丽丽;谢亮;王峰;;鸡热休克蛋白70基因克隆、单核苷酸多态性检测及生物信息学分析[J];中国畜牧兽医;2014年03期

5 蔡小宁;陈茜;杨平;任源浩;;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2008年03期

6 陈尘;王政军;曹鑫林;王U喼，

本文编号：1702632