基于核基因LEAFY的中国珍稀濒危植物中华水韭的遗传多样性分析

发布时间：2018-04-13 17:26

  本文选题：中华水韭 + LEAFY基因　； 参考：《植物科学学报》2017年01期

【摘要】：利用核基因LEAFY第二个内含子片段对中国现存中华水韭(Isoetes sinensis Palmer)的遗传多样性进行分析,探讨了中华水韭自然居群的遗传多样性结构及其形成机制。结果显示:现存中华水韭7个自然居群共105个样本中存在78个单倍型,单倍型多样性(H_d)为0.989,核苷酸多样性(π)为0.021,遗传差异主要存在于居群内(72%),且存在较高的基因流(N_m=0.59)。同时,居群遗传学分析结果发现中华水韭居群不存在明显的谱系地理格局(G_(ST)N_(ST));Mantel检验中Rxy值为-0.286,P(rxy-rand≥rxy-data)值为0.370,表明居群遗传距离和地理距离之间没有明显相关性;UPGMA聚类分析显示处于海拔较高位置的2个居群与其它5个居群遗传关系较远;中性检验(Taijima's D、FuLi's D*和F*)检测结果均为负值,基于稳定模型的失配分布检测显示为多峰。根据中华水韭居群的地理位置,推测中华水韭的遗传结构可能与水系、海拔分布及其杂交后代多倍化的物种形成过程相关。
[Abstract]:The genetic diversity of Isoetes sinensis Palmer in China was analyzed by using the second intron fragment of nuclear gene LEAFY, and the genetic diversity structure and formation mechanism of the natural population of Isoetes chinensis were discussed.The results showed that there were 78 haplotypes (Hd) and 0.021 nucleotide diversity (蟺) in 105 samples of 7 natural populations of leek sinensis.At the same time,The results of population genetics analysis showed that there was no obvious phylogenetic pattern in the population of Allium sinensis, and the Rxy value of Mantel test was -0.286 Prxy-rand 鈮，

本文编号：1745489