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单细胞水平原钙黏蛋白基因簇的转录分析

发布时间:2018-05-10 13:00

  本文选题:原钙黏蛋白基因簇 + 表达模式 ; 参考:《江苏农业科学》2017年02期


【摘要】:原钙黏蛋白(protocadherin,Pcdh)基因簇由紧密相连的3个基因簇(Pcdhα、Pcdhβ和Pcdhγ)组成,其中α、β基因簇包含可变区外显子(C型和非C型)和恒定区外显子。这种独特的基因排列方式使Pcdh基因簇具有产生单细胞分子多样性的潜能。目前,在单细胞水平有关Pcdh基因簇转录表达的研究较少。为了探索单细胞Pcdh基因簇的转录表达模式,利用显微操作系统并结合RT-PCR方法,在单细胞水平分析了小鼠大脑皮层和人类神经母细胞瘤细胞系SK-N-SH的Pcdhα和Pcdhβ基因簇表达模式。研究发现Pcdhα和Pcdhγ的C型和非C型亚型均是随机表达,每个单细胞表达不同组合的若干个Pcdh基因簇亚型。本研究表明,在小鼠大脑皮层及人类神经母细胞瘤的单个细胞中,Pcdh基因簇的转录表达都能够产生单细胞表面分子多样性。这为进一步揭示神经元中Pcdh基因簇表达调控的分子机理及其在大脑神经回路中的功能奠定理论基础。
[Abstract]:The protocadherin (Pcdh) gene cluster consists of three closely linked gene clusters, Pcdh 伪, Pcdh 尾 and Pcdh 纬, in which 伪, 尾 gene clusters contain C type and non C type variable region exons) and constant region exons. This unique gene arrangement makes the Pcdh gene cluster have the potential to produce single cell molecular diversity. At present, there are few studies on transcriptional expression of Pcdh gene cluster at single cell level. In order to explore the transcriptional expression pattern of single cell Pcdh gene cluster, the expression patterns of Pcdh 伪 and Pcdh 尾 gene clusters in mouse cerebral cortex and human neuroblastoma cell line SK-N-SH were analyzed at single cell level using microoperating system and RT-PCR method. It was found that the C and non C subtypes of Pcdh 伪 and Pcdh 纬 were randomly expressed, and each single cell expressed several Pcdh gene cluster subtypes with different combinations. This study showed that the transcriptional expression of Pcdh gene cluster in mouse cerebral cortex and single cell of human neuroblastoma can produce single cell surface molecular diversity. This provides a theoretical basis for further understanding the molecular mechanism of the expression and regulation of Pcdh gene clusters in neurons and its function in the neural circuits of the brain.
【作者单位】: 上海交通大学生命科学技术学院;上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心/系统生物医学教育部重点实验室;
【基金】:国家自然科学基金(编号:91519302,812111583) 中国博士后科学基金(编号:2015M571558) 上海市科学技术委员会科研计划(编号:14JC1403601)
【分类号】:Q78

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