新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-05-15 20:46

  本文选题：野扁桃 + 转录因子　； 参考：《分子植物育种》2017年01期

【摘要】：以野扁桃为实验材料,提取叶片的RNA,设计基因特异性引物,利用RT-PCR克隆转录因子CBF的c DNA全长,命名为Als CBF1-A(登录号KU975456);并对其基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该转录因子基因的CDS区长699 bp,编码232个氨基酸,编码蛋白相对分子质量约为26.027 2 k D,p I 4.84;由无规则卷曲(C),α-螺旋(H),β-折叠(E)组成,分别占52.17%,21.74%和26.09%;有较强的亲水性,无跨膜区和信号肽存在,有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点;同源性分析表明Als CBF1-A基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关,此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。
[Abstract]:The gene and protein of wild almond were analyzed . The results showed that the length of the transcription factor gene was 699 bp , and it was named Als CBF1 - A ( accession number KU975456 ) . The results showed that the length of the transcription factor gene was 699 bp , and the relative molecular weight of the coding protein was 26 . 17 % , 21.74 % and 26.09 % , respectively .

【作者单位】： 新疆农业大学农学院;新疆农业科学院园艺作物研究所;新疆农业大学林学与园艺学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31260186) 国家大学生创新创业训练计划项目(201400758001) 新疆维吾尔自治区“十二五”科技重大专项(201130102-1) 新疆维吾尔自治区果树学重点学科基金(201107)共同资助
【分类号】：S662.9;Q943.2
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本文编号：1893884