基于NRPSs基因筛选与鉴定海芦笋内生细菌

发布时间：2018-05-16 05:32

  本文选题：内生细菌 + 分离鉴定　； 参考：《食品与发酵工业》2017年09期

【摘要】：利用形态学观察和分子生物学相结合的方法分离鉴定海芦笋内生细菌,并筛选含有NRPS基因的菌株(nonribosomal peptide synthetase,NRPS),以期获得能够产生环肽化合物的菌株。研究结果表明,共从海芦笋中分离到6株内生细菌Srtli-F1~Srtli-F6,分别鉴定为绿针假单胞菌橙黄亚种(Pseudomonas chlororaphis subsp.aurantiaca)、组氨酸节杆菌(Arthrobacter histidinolovorans)、庆盛芽孢杆菌(Bacillus qingshengii)、类芽孢杆菌羽扇豆根瘤菌(Paenibacillus lupini)、假蕈状芽孢杆菌(Bacillus pseudomycoides)、高山麝病原性阿尔伯蒂埃希氏杆菌(Escherichia albertii),其中菌株Srtli-F5检测到含有NRPS基因,经系统发育树分析,预测该菌株可能产生环肽类化合物,该株菌经过发酵,有机溶剂萃取发酵产物,并用电喷雾质谱ESI-MS(electrospray mass,ESI-MS)分析Srtli-F5能产生环肽化合物——杆菌肽,证实了该预测结果。该研究为定向筛选能够产生环肽类化合物的菌种开拓了新思路。
[Abstract]:Using the method of combining morphological observation and molecular biology to isolate and identify the endophytic bacteria of asparagus asparagus, and screening the strains containing NRPS gene (nonribosomal peptide synthetase, NRPS), in order to obtain the strains capable of producing cyclic peptide compounds. The results showed that 6 strains of endophytic bacteria Srtli-F1~Srtli-F6 were isolated from the asparagus sea asparagus, respectively. Identified as Pseudomonas aeruginosa (Pseudomonas chlororaphis subsp.aurantiaca), histidine Arthrobacter (Arthrobacter histidinolovorans), Bacillus subtilis (Bacillus qingshengii), Bacillus lupus lupus Rhizobium (Paenibacillus lupini), Bacillus Mycosis (Bacillus pseudomycoides), Alpine Musk. The strain Srtli-F5 (Escherichia albertii), in which the strain Srtli-F5 detected the NRPS gene, was analyzed by phylogenetic tree and predicted that the strain could produce cyclo peptides. The strain was fermented by fermentation, the fermentation product was extracted by organic solvent, and the cyclic peptide could be produced by the electrospray ionization mass spectrometry ESI-MS (electrospray mass, ESI-MS). The bacilli peptide has confirmed the prediction results. This research has opened up a new way for screening strains that can produce cyclones.

【作者单位】： 南京农业大学食品科技学院;
【基金】：2017年农产品质量安全风险评估项目(GJFP201701102) 2016年南京农业大学大学生创新训练计划(SRT)项目(1618C01)
【分类号】：TS201.3

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