杨树、葡萄、拟南芥和水稻WRKY Ⅲ基因家族比较及表达分析

发布时间：2018-05-26 08:29

  本文选题：WRKY + Ⅲ　； 参考：《安徽农业大学》2016年硕士论文

【摘要】：WRKY Ⅲ基因在植物生长调节和抗逆性方面发挥重要作用。WRKY基因在很多植物中都已经被研究报道,然而WRKY Ⅲ基因在木本植物杨树与三个开花植物的代表家系:拟南芥、葡萄和水稻中仍缺乏一个全面的分析。杨树作为一个大型且多年生的木本植物,与拟南芥、葡萄和水稻相比较有着不同的生命周期,其生长发育和基因调控网络可能更加的复杂。本研究中,主要从染色体位置、系统发育、基因结构、保守基序、保守的共线性、基因复制等方面四个物种的WRKY Ⅲ基因家族进行分析,并对杨树WRKY Ⅲ基因家族进行同义置换率(Synonymous substitutions rate,Ks)及表达模式分析。通过研究主要获得以下结果:1.在杨树(毛果杨)、葡萄、拟南芥和水稻中确定出WRKY Ⅲ基因,尽管这些基因的分布是随机的,但它们的蛋白相关理化性质是趋向一致的。2.将57个WRKY Ⅲ基因序列进行比对并构建系统进化树,结果表明这些基因可以被分成四个进化枝(clade 1、clade 2、clade 3和clade 4),同时发现旁系同源基因较多,却仅含有2对直系同源基(PtrWRKY54/VvWRKY42、PtrWRKY30/VvWRKY52)。3.基因结构分析结果表明它们的内含子/外显子数量均不同,有些旁系同源基因的结构也不同,进化时期中发生了内含子/外显的丢失或者获得事件;基序分析结果表明进化关系比较近的蛋白在基序组成模式上相同。4.共线性结果表明杨树和葡萄间的复制区域比拟南芥或水稻间更加的保守,每个物种内除了全基因组复制事件还存在其他独立的重复事件;对杨树WRKY Ⅲ基因进行Ks分析,结果显示:PtrWRKYⅢ所有复制区块都是在在单子叶植物与双子叶植物发生分歧之后才产生形成的;多数PtrWRKYⅢ是通过大规模复制产生;强烈的纯化选择在维持PtrWRKYⅢ功能的进化方面发挥着重要的作用。5.毛果杨(南林95)组织表达模式分析发现有5个基因(PtrWRKY30、-54、-55、-63、-90)在木质部中表达量最高;诱导表达模式分析显示,多数PtrWRKYⅢ在被100μM水杨酸(Salicylic Acid,SA)、25%聚乙二醇(Polyethylene Glycerol,PEG)6000、100μM脱落酸(Abscisic Acid,ABA)处理后的表达量发生明显变化。
[Abstract]:WRKY 鈪，

本文编号：1936548