ATP结合盒转运子A1基因多态性及其与环境的交互作用与低HDL-C血症关系的研究

发布时间：2018-06-03 13:37

  本文选题：维吾尔族 + 哈萨克族　； 参考：《石河子大学》2017年硕士论文

【摘要】：目的1.探讨哈萨克族、维吾尔族ABCA1基因rs2230806、rs4149313、rs2275542、rs2515602、rs3890182、rs1800976位点多态性与低HDL-C血症的关系;2.分析哈萨克族、维吾尔族ABCA1基因rs2230806、rs4149313、rs2275542、rs2515602、rs3890182、rs1800976位点多态性与环境的交互作用、各位点之间的交互作用与低HDL-C血症的关系;3.分析哈萨克族、维吾尔族ABCA1基因rs2230806、rs4149313、rs2275542、rs2515602、rs3890182、rs1800976位点多态性与血脂水平之间的关系;4.分析哈萨克族和维吾尔族中ABCA1基因rs2230806、rs4149313、rs2275542、rs2515602、rs3890182、rs1800976位点多态性是否存在连锁不平衡现象,分析6位点构成的单体型与维吾尔族、哈萨克族低HDL-C血症的关系。方法:1.在现况调查建立的数据库基础上,随机抽取哈萨克族、维吾尔族低HDL-C血症患者204例、263例作为病例组,并从同一人群中随机抽取两民族HDL-C正常个体207例、275例作为对照组;2.应用SNa Pshot SNP分型技术分别检测所有研究对象的ABCA1基因rs2230806、rs4149313、rs2275542、rs2515602、rs3890182、rs1800976位点的多态性;3.利用SPSS 20.0统计软件包对实验数据进行统计学处理,统计学分析方法有χ2检验、t检验、秩和检验,单因素和多因素分析采用logistic回归分析,基因-环境交互作用采用非条件的logistic回归分析,基因-基因交互作用采用多因子降维方法分析(GMDR软件),连锁不平衡和单体型分析采用SHEsis在线软件进行处理。结果:1.哈萨克族ABCA1基因6个SNP位点中,病例组和对照组rs2515602、rs2230806和rs4149313位点基因型和等位基因频率分布存在差异(p均0.05),其中病例组rs2515602-C等位基因频率高于对照组(60.8%vs 43.9,p0.001),对照组rs2230806-A等位基因频率低于病例组(31.2%vs 45.6%,p0.001),对照组rs4149313-A等位基因频率高于病例组(68.1%vs 54.4%,p0.001);2.哈萨克族人群中,rs3890182、rs2275542和rs1800976位点多态性与血脂水平无关(p均0.017)。rs2515602-CC基因型个体血清HDL-C水平低于rs2515602-CT/TT基因型个体,rs2515602-CT基因型个体血清HDL-C水平低于rs2515602-TT基因型个体,rs2515602-TT基因个体TC水平高于rs2515602-CC基因型个体(p0.017)。rs2230806-AA基因型个体HDL-C水平低于rs2230806-GG基因型个体。rs4149313-AA基因型个体血清HDL-C水平高于rs4149313-AG/GG基因型个体,rs4149313-AA基因型个体血清TC水平高于rs4149313-GG基因型个体(p0.017)。;3.肥胖(OR=1.460;95%CI:1.185-1.797;p0.001)、rs2516602(OR=1.666;95%CI:1.115-2.488;p=0.013)和rs4149313(OR=1.722;95%CI:1.152-2.572;p=0.008)位点突变是哈萨克族低HDL-C血症的独立危险因素,肥胖和rs4149313位点(OR=1.753;95%CI:1.171-2.624;p=0.006)的交互作用与哈萨克族低HDL-C血症发生存在相关性;4.多因子降维分析结果显示:哈萨克族ABCA1基因最优的交互作用模型是rs2515602和rs2275542位点联合作用模式(p=0.0107),且该作用模型表现为拮抗作用。rs2515602、rs2275542和rs1800976位点也具有交互作用(p=0.0107);5.哈萨克族rs2230806与rs2515602(D'=0.821),rs4149313与rs2515602(D'=1)间存在连锁不平衡关系;6.ABCA1的6个位点在哈萨克族人群中所构建的单体型有36种,C-C-G-A-G-G、T-T-T-G-G-A、C-C-C-A-G-G、C-C-G-G-G-G、C-C-G-A-G-A、T-C-C-G-G-G、T-C-C-A-G-G、T-C-C-A-G-A、T-T-C-G-G-A单体型频率在病例组与正常对照组间的差异有统计学意义(p均0.05);7.维吾尔族ABCA1基因6个SNP位点中,病例组和对照组rs2515602、rs2230806和rs4149313位点基因型和等位基因频率分布存在差异(p均0.05),其中病例组rs2515602-C等位基因频率高于对照组(59.1%vs 52.4,p=0.026),对照组rs2230806-A等位基因频率低于病例组(32.4%vs 39.4%,p=0.017),对照组rs4149313-A等位基因频率高于病例组(64.4%vs 52.7%,p0.001);8.rs3890182、rs2275542和rs2230806位点多态性与维吾尔族血脂水平无关(p均0.017)。rs2515602-CC/CT基因型个体血清TG水平高于rs2515602-TT基因型个体(p0.017)。rs1800976-CG基因型个体血清TG、TC和LDL-C水平高于rs1890976-GG基因型个体(p0.017);rs4149313-AA基因型个体血清TG水平低于rs4149313-GG基因型个体,rs4149313-AA基因型个体血清HDL-C水平高于rs4149313-GG基因型个体,(p0.017);9.肥胖(OR=1.235;95%CI:1.102-1.384;p0.001)、高血压(OR=1.316;95%CI:1.102-1.573;p=0.002)和rs4149313位点(OR=1.718;95%CI:1.238-2.385;p=0.001)突变是维吾尔族低HDL-C血症的独立危险因素,与男性相比较女性是(OR=0.383;95%CI:0.257-0.571;p0.001)维吾尔族低HDL-C血症的保护因素。肥胖(OR=1.556;95%CI:1.247-1.941;p0.001)、性别(OR=1.542;95%CI:1.070-2.223;p=0.02)、高血压(OR=1.334;95%CI:1.131 1.573;p0.001)分别与rs4149313位点的交互作用与维吾尔族低HDL-C血症发生存在相关性;10.多因子降维分析结果显示:维吾尔族ABCA1基因最优的交互作用模型是:rs4149313和rs1800976位点的交互作用(p=0.0010)为最佳模型,且该作用模型表现为协同作用,rs2230806、rs1800976和rs4149313位点也具有交互作用(p=0.0010);11.维吾尔族ABCA1基因rs2275542与rs3890182(D'=0.801),rs2515602与rs2230806(D'=0.870)、rs3890182(D'=0.741)、rs4149313(D'=1)位点间存在连锁不平衡关系;12.ABCA1的6个位点在维吾尔族人群中所构建的单体型有39种,C-T-G-G-G-A、C-C-C-A-G-G、T-C-G-G-G-G、T-C-G-A-G-G、T-C-G-A-G-A单体型频率在病例组与正常对照组间的差异有统计学意义(p均0.05)。结论:1.ABCA1基因6个SNP位点中,rs2515602、rs2275542、rs2230806和rs4149313位点基因型多态性与新疆哈萨克族低HDL-C血症的发病风险相关,rs2515602-T等位基因、rs2230806-G等位基因可能是哈萨克族低HDL-C血症的保护因素,rs4149313-G等位基因可能是哈萨克族低HDL-C血症的危险因素,rs2275542-CT基因型可能是哈萨克族低HDL-C的危险因素;2.哈萨克族人群中,ABCA1基因rs2515602、rs4149313和rs2230806位点多态性与HDL-C水平相关,rs2515602和rs4149313位点多态性与TC水平相关;3.肥胖、rs2516602和rs4149313位点突变是哈萨克族低HDL-C血症的独立危险因素,肥胖分别与rs2515602和rs4149313位点的交互作用与哈萨克族低HDL-C血症发生存在相关性;4.多因子降维分析结果显示:哈萨克族ABCA1基因最优的交互作用模型是rs2515602和rs2275542位点联合作用模式,且该作用模型表现为拮抗作用,rs2515602、rs2275542和rs1800976位点也具有交互作用;5.哈萨克族rs2230806与rs2515602,rs4149313与rs2515602间存在连锁不平衡关系;6.相对于C-T-G-G-G-A单体型,单体型C-C-G-A-G-G、T-T-T-G-G-A、C-C-C-A-G-G、C-C-G-G-G-G、C-C-G-A-G-A、T-C-C-G-G-G、T-C-C-A-G-G、T-C-C-A-G-A是哈萨克族低HDL-C血症的危险因素,而单体型T-T-C-G-G-A是哈萨克族低HDL-C血症的保护因素;7.ABCA1基因6个SNP位点中,rs2515602、rs2230806和rs4149313位点基因型多态性与维吾尔族低HDL-C血症的发病风险相关,rs2515602-T等位基因、rs2230806-G等位基因可能是维吾尔族低HDL-C血症的保护因素,rs4149313-G等位基因可能是维吾尔族低HDL-C血症的危险因素;8.维吾尔族人群中,ABCA1基因rs4149313位点多态性与HDL-C水平相关,rs1800976位点多态性与LDL-C水平相关,rs2515602、rs4149313和rs1800976位点多态性与TG水平相关,rs1800976位点多态性与TC水平相关;9.肥胖、男性、高血压和rs4149313位点突变是维吾尔族低HDL-C血症的独立危险因素,肥胖、男性、高血压分别与rs4149313位点的交互作用与维吾尔族低HDL-C血症发生存在相关性;10.多因子降维分析结果显示:维吾尔族ABCA1基因最优的交互作用模型是:rs4149313和rs1800976位点的交互作用为最佳模型,且该作用模型表现为协同作用,rs2230806、rs1800976和rs4149313位点也具有交互作用;11.维吾尔族ABCA1基因rs2275542与rs3890182,rs2515602与rs2230806、rs3890182、rs4149313位点间存在连锁不平衡关系;12.相对于C-T-G-G-G-A单体型,单体型C-C-C-A-G-G、T-C-G-G-G-G、T-C-G-A-G-G是维吾尔族低HDL-C血症的危险因素,单体型T-C-G-A-G-A与维吾尔族低HDL-C血症的保护因素。
[Abstract]:Objective To investigate the relationship between the polymorphism of rs2230806 , rs4149313 , rs2230806 , rs3890182 , rs1800976 , rs2515602 , rs3890182 , rs1800976 , rs2515602 , rs3890182 , rs1800976 , rs2515602 , rs3890182 , rs1800976 and rs1800976 . Results : 1 . The frequencies of rs2515602 - C allele in rs2515602 - CC genotype were lower than those in the control group ( 60.8 % vs 43.4 % , p0.001 ) . There was a linkage disequilibrium between the interaction of rs2515602 , rs2230806 , rs2515602 ( D ' = 0.821 ) , rs4149313 and rs2515602 ( D ' = 1 ) . 42鍜宺s2230806浣嶇偣澶氭，

本文编号：1972972