西瓜CBL家族基因的鉴定与特征分析

发布时间：2018-06-09 15:17

  本文选题：西瓜 + CBL基因　； 参考：《北方园艺》2017年15期

【摘要】：CBL基因在植物逆境应答过程中具有重要作用,但在西瓜作物的抗逆育种研究中鲜有相关报道。该研究利用生物信息学的分析方法从已发表的西瓜全基因组中鉴定出7个CBL基因(ClaCBL1~ClaCBL7),并分析了它们在全基因组范围内的分布情况、分子结构特征、顺式元件以及系统进化等基本特征,为进一步研究西瓜CBL基因的功能提供参考。结果表明:西瓜CBL基因在全基因组中的分布是不均匀的,其中仅ClaCBL4基因有9个外显子,其余基因均为8个外显子,编码区序列大小在639~738bp。在进化上西瓜CBL基因分为3个不同的类群;它们编码区域内的氨基酸序列均含有能与CIPK互作的FSPF高保守性位点及能与钙离子结合的3个EF-hand结构;除了ClaCBL1预测定位在胞外基质中,其余的ClaCBL定位在细胞内的不同部位;在西瓜CBL基因启动子上游的序列中存在多个应答不同逆境和植物激素的顺式元件,而且CBL家族不同成员基因含有的顺式元件的种类和数目各不相同。上述分析显示,西瓜CBL可能参与多种生物学过程,而且不同成员存在功能上的分化。
[Abstract]:The results showed that the distribution of CBL4 gene was non - uniform in the whole genome . The results showed that there were 9 exons and 3 EF - hand structures in the whole genome of watermelon .
【作者单位】： 东北农业大学园艺园林学院农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金面上资助项目(31572144) 国家西甜瓜产业技术体系-分子育种岗位资助项目(CARS-26-02)
【分类号】：S651

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本文编号：2000169