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中华鳖tyrp-1基因的生物信息学分析

发布时间:2018-06-15 21:32

  本文选题:中华鳖 + tyrp-基因 ; 参考:《河北大学学报(自然科学版)》2017年03期


【摘要】:为阐明中华鳖酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP-1)基因tyrp-1及蛋白质结构与性质,利用相关软件、数据库和方法对其进行了生物信息学分析.结果显示,基因转录本全长为2 829bp,编码535个aa.预测TYRP-1蛋白分子质量为60.16ku,理论等电点为5.35,为不稳定蛋白;N端含有信号肽,与信号识别蛋白结合后,促进其穿越内质网膜进入内质网腔;C端含有跨膜结构域,锚定于细胞膜上,发挥重要的生物学功能;TYRP-1蛋白含有2个铜离子结合结构域,与DCT蛋白有明显的相互作用.
[Abstract]:In order to elucidate the tyrp-1 and protein structure and properties of tyrosinase associated protein 1 (TYRP-1) gene in Trionyx sinensis, bioinformatics analysis was carried out by using relevant software, database and method. The results showed that the full length of the transcripts was 2 829 BP, encoding 535 aas. It was predicted that the molecular weight of TYRP-1 protein was 60.16kuand the theoretical isoelectric point was 5.35. It was suggested that the N-terminal of TYRP-1 protein contained signal peptide. After binding with signal recognition protein, TYRP-1 protein was promoted to cross the endoplasmic omentum into the endoplasmic reticulum cavity and the C-terminal contained transmembrane domain, which was anchored on the cell membrane. TYRP-1 protein, which plays an important biological function, contains two copper ion-binding domains and interacts with DCT protein.
【作者单位】: 河北大学生命科学学院;保定水产技术推广站;
【基金】:河北省自然科学基金资助项目(C2016201207) 河北省现代农业产业技术体系淡水养殖创新团队项目
【分类号】:S917.4

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