羊口疮病毒重庆株F1L基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2018-06-20 13:28

  本文选题：羊口疮病毒 + FL基因　； 参考：《西北农业学报》2017年09期

【摘要】：旨在分析OrfV-CQ株F1L基因的分子特点,预测其编码蛋白的生物学功能。对OrfV-CQ株F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,利用生物信息学相关软件进行序列分析并对其编码蛋白的二级结构、B细胞表位、T细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽进行预测。结果表明,OrfV-CQ株F1L基因长1 023bp,编码340个氨基酸,与Shanxi株F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%和95.0%。OrfV-CQ株F1L基因编码蛋白的α-螺旋、β-片层、β-转角、无规则卷曲分别为11.21%、10.3%、2.73%、75.76%;可能存在5个B细胞优势抗原表位,3个CTL表位,4个Th细胞表位,无跨膜结构域和信号肽。
[Abstract]:The aim of this study was to analyze the molecular characteristics of the F1L gene of OrfV-CQ strain and to predict its biological function. The F1L gene of OrfV-CQ strain was amplified by PCR, cloned, sequenced and sequenced by bioinformatics software. Transmembrane domain and signal peptide were predicted. The results showed that the length of F1L gene of OrfV-CQ strain was 1 023bpand encoding 340 amino acids. The nucleotide and amino acid homology of F1L gene of OrfV-CQ strain was 98.4% and 95.0%, respectively. The 伪 -helix, 尾 -lamellar, 尾 -rotation angle of F1L gene encoding protein of OrfV-CQ strain were 98.4% and 95.0%, respectively. The irregular curls were 11.21 / 10.3 and 2.730.75.76.The B cell epitopes, 3 CTL epitopes, 4 Th cell epitopes, no transmembrane domain and signal peptides may exist.
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院;贵州省动物疫病研究所;
【基金】：贵州省科学技术基金[LH(2014)7667] 贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队[(2015)4016]~~
【分类号】：S852.65

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