新疆油鸡禽流感病毒Xj14分离株PA基因的克隆与序列分析

发布时间：2018-06-24 01:32

  本文选题：禽流感病毒 + 油鸡　； 参考：《江苏农业科学》2017年08期

【摘要】：为了从分子水平上掌握新疆油鸡H9N2亚型禽流感病毒PA基因的遗传进化情况,采用RT-PCR技术对新疆油鸡分离株Xj14的PA基因进行克隆、测序及分子进化分析,将PA基因的核苷酸序列和对应的氨基酸序列与Gen Bank中已经公布的参考序列进行同源性比较。结果表明,新疆油鸡分离株的PA基因由2 151个碱基组成,编码716个氨基酸,与AIV A/Duck/Hong Kong/Y439/97的PA基因处于同一分支,其核苷酸和氨基酸水平的同源性依次为89.9%和96.9%,在系统进化上属于欧亚分支中的Y439谱系。
[Abstract]:In order to understand the genetic evolution of PA gene of Xinjiang oil chicken H9N2 subtype avian influenza virus from molecular level, the PA gene of Xinjiang oil chicken isolate Xj14 was cloned, sequenced and molecular evolution analyzed by RT-PCR. The nucleotide sequence and corresponding amino acid sequence of PA gene were compared with the reference sequence published in GenBank. The results showed that the PA gene was composed of 2151 bases and encoded 716 amino acids, which was at the same branch as the PA gene of AIV A / Duckr / Hong Kong / Y439 / 97. The homology of nucleotide and amino acid level was 89. 9% and 96. 9%, respectively, and belonged to the Y439 lineage of Eurasian branch in phylogeny.
【作者单位】： 塔里木大学;新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室;新疆库车县动物疾病预防控制中心;阿克苏地区动物疫病控制诊断中心;新疆阿瓦提县畜禽改良站;
【基金】：国家自然科学基金(编号:31160513)
【分类号】：S852.65

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本文编号：2059370