番茄PIN2基因的生物信息学分析
本文选题:番茄 + PIN基因 ; 参考:《分子植物育种》2017年07期
【摘要】:PIN基因家族是调控生长素运输的重要输出载体。拟南芥PIN2介导的生长素极性运输在生长素不对称分布在根的向重力性反应中起着关键性调控作用(潘建伟等,2010)。植物根系的重力性决定着根系空间生长的趋势,对植物养分的吸收有着重要的影响。本研究选择功能已知的拟南芥PIN2基因为参考序列,对番茄PIN2基因开展了蛋白组分和理化性质,系统进化分析,蛋白结构预测,跨膜结构分析等生物信息学研究,为番茄PIN2基因的生物学功能及分子机理提供理论基础。
[Abstract]:PIN gene family is an important output vector regulating auxin transport. PIN2-mediated polar transport of auxin in Arabidopsis thaliana plays a key role in the asymmetric distribution of auxin in the root gravity response (Pan Jianwei et al. 2010). The gravity of plant roots determines the trend of root space growth and has an important effect on plant nutrient absorption. In this study, the PIN2 gene of Arabidopsis thaliana was selected as the reference sequence. The protein composition and physicochemical properties, phylogenetic analysis, protein structure prediction and transmembrane structure analysis of tomato PIN2 gene were studied in bioinformatics. It provides a theoretical basis for the biological function and molecular mechanism of tomato PIN2 gene.
【作者单位】: 东北农业大学园艺园林学院;东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;
【基金】:现代农业产业技术体系专项基金(CARS-25-A-15) 国家自然科学基金(31272171) 黑龙江省大宗蔬菜新品种选育(GA15B103)项目 农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室开放课题基金项目共同资助
【分类号】:Q943.2;S641.2
【参考文献】
相关期刊论文 前4条
1 王博;曹红利;黄玉婷;胡玉荣;钱文俊;郝心愿;王璐;杨亚军;王新超;;茶树生长素外运载体基因CsPIN3的克隆与表达分析[J];作物学报;2016年01期
2 魏力军;康金超;董旭阳;王涛;;微重力对植物向重力性的影响[J];哈尔滨师范大学自然科学学报;2015年01期
3 孔静;王伯初;王益川;杨兴艳;;拟南芥根中生长素极性运输的研究进展[J];生命科学研究;2013年05期
4 潘建伟;叶晓帆;王超;涂世伟;;拟南芥PIN2介导的生长素极性运输调控植物根向地性[J];浙江师范大学学报(自然科学版);2010年01期
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1 李远婷;拟南芥NPY基因对根向重力性的研究[D];兰州大学;2012年
2 胡利伟;水稻叶鞘基部的负向重性反应及拟南芥和水稻的空间搭载实验[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2007年
【共引文献】
相关期刊论文 前7条
1 张春利;袁岐;赵婷婷;许向阳;;番茄PIN2基因的生物信息学分析[J];分子植物育种;2017年07期
2 莫亿伟;李夏杰;王海;陈泽恺;杨国;王尉;;IAA对水稻根毛形成与水通道蛋白基因表达关系的研究[J];中国农业科学;2015年21期
3 李琰;詹晓平;杨静;刘林;李成云;;PIN2蛋白在水稻根尖细胞中定位方法的优化[J];山东农业科学;2015年08期
4 赵亚波;卜贤盼;李培纲;王路蝉;陈晶晶;莫亿伟;;OsPIN1a基因在水稻植株不同组织表达与定位研究[J];生物技术;2014年01期
5 付伟;严旭;王超;潘建伟;;生长素调控极性运输载体PIN2质膜丰度与降解[J];浙江师范大学学报(自然科学版);2013年03期
6 任怡怡;戴绍军;刘炜;;生长素的运输及其在信号转导及植物发育中的作用[J];生物技术通报;2012年03期
7 陈晓阳;谢文军;罗海山;罗红兵;;植物生长素运输载体研究进展[J];作物研究;2011年06期
【二级参考文献】
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1 曹红利;岳川;郝心愿;王新超;杨亚军;;茶树胆碱单加氧酶CsCMO的克隆及甜菜碱合成关键基因的表达分析[J];中国农业科学;2013年15期
2 陈瑜;鹿金颖;李华盛;赵滢;苏亮;刘敏;;空间环境和模拟微重力环境下番茄试管苗的开花结实实验[J];航天医学与医学工程;2013年03期
3 邹纯雪;门淑珍;;生长素的外输载体PIN蛋白家族研究进展[J];中国细胞生物学学报;2013年05期
4 ;空间站实验显示没有重力植物仍能正常生长[J];载人航天;2013年01期
5 郝心愿;曹红利;杨亚军;王新超;马春雷;肖斌;;茶树生长素响应因子基因CsARF1的克隆与表达分析[J];作物学报;2013年03期
6 丁懿;石彩娟;王万军;;水稻PIN家族的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2012年27期
7 宫喜魁;赵琦;郭双生;孙建锋;吴承菲;;模拟微重力对拟南芥幼苗的影响[J];生物技术通报;2011年10期
8 郭东林;蒿若超;唐凤兰;张月学;;太空微重力对植物生长发育的影响[J];湖北农业科学;2011年05期
9 肖媛;王高鸿;刘永定;;植物细胞响应重力变化的Ca~(2+)信号[J];空间科学学报;2011年01期
10 吕毅;骞爱荣;商澎;;细胞骨架在植物重力感受和感知中的作用研究进展[J];西北植物学报;2010年08期
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2 付伟;严旭;王超;潘建伟;;生长素调控极性运输载体PIN2质膜丰度与降解[J];浙江师范大学学报(自然科学版);2013年03期
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1 曹华苹;拟南芥和水稻PIN2材料的耐铝性研究[D];华南农业大学;2016年
,本文编号:2080494
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