基于毛木耳CDS的福寿螺多功能纤维素酶基因密码子优化分析

发布时间：2018-07-21 19:17

【摘要】：【目的】克隆福寿螺多功能纤维素酶基因(multi-functional cellulase gene,Mfc),进行密码子优化改造,便于后续毛木耳Mfc基因转导研究。【方法】采用Codon W软件分析福寿螺多功能纤维素酶基因Mfc及毛木耳转录本CDS密码子使用次数和同义密码子相对使用度差异,以毛木耳CDS密码子特征对福寿螺Mfc基因进行密码子优化。【结果】改造后的Mfcsg序列GC含量从原始Mfc序列的54.04%增加到58.16%,与毛木耳遗传背景一致。【结论】实验优化后获得的Mfcsg基因序列GC含量与毛木耳遗传背景一致,没有发夹结构、重复序列及反向重复序列,能够作为毛木耳外源基因转化应用。
[Abstract]:[objective] to clone the multifunctional cellulase gene (multi-functional cellulase gene MFC) from snail, and to optimize the codon modification. [methods] the multifunctional cellulase gene MFC and CDS codon were analyzed by Codon W software. The codon of MFC gene was optimized by CDS codon characteristics of Auricularia tuber. [results] the GC content of the modified Mfcsg sequence increased from 54.04% of the original MFC sequence to 58.16% of the original MFC sequence, which was consistent with the genetic background of Auricularia tuber. [conclusion] Experimental optimization. The GC content of Mfcsg gene sequence was consistent with the genetic background of Auricularia pubescens. No hairpin structure, repeat sequence and reverse repeat sequence can be used as foreign gene transformation of Auricularia pubescens.
【作者单位】： 四川省农业科学院土壤肥料研究所;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室;
【基金】：四川省财政创新能力提升工程项目(2014QNJJ-012) 突破性食用菌新品种选育、育种材料与方法创新项目“毛木耳抗病新品种选育研究” 国家食用菌产业技术体系(CARS-24) 四川食用菌创新团队
【分类号】：S646.6

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本文编号：2136574